More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2413 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2413  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  100 
 
 
276 aa  550  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1512  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  49.45 
 
 
282 aa  249  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2010  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  47.83 
 
 
284 aa  244  1e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1819  medium FAD-binding subunit of molybdenum enzyme  42.86 
 
 
280 aa  222  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1959  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  36.57 
 
 
294 aa  176  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1738  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  35.58 
 
 
305 aa  169  7e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2772  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.24 
 
 
283 aa  164  2e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.37285e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3000  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  35.27 
 
 
292 aa  161  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0841  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  34.88 
 
 
292 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0825  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  34.88 
 
 
292 aa  160  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3192  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  34.88 
 
 
292 aa  161  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3027  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  34.88 
 
 
292 aa  160  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02662  hypothetical protein  34.88 
 
 
292 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02700  xanthine dehydrogenase, FAD-binding subunit  34.88 
 
 
292 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4157  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  34.88 
 
 
292 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533292 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2153  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.09 
 
 
292 aa  155  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.891805 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1423  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  34.35 
 
 
295 aa  154  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1137  dehydrogenase  37.84 
 
 
282 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  35.79 
 
 
450 aa  152  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2836  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding protein  36.52 
 
 
289 aa  149  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0853655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1444  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  37.63 
 
 
280 aa  147  2e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1733  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30.22 
 
 
292 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2646  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  34.24 
 
 
283 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1788  xanthine dehydrogenase, small subunit  36.9 
 
 
467 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350368  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  36.96 
 
 
461 aa  143  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3460  xanthine dehydrogenase, small subunit  35.93 
 
 
530 aa  143  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5969  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  37.04 
 
 
275 aa  141  1e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4005  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.67 
 
 
287 aa  140  2e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218277  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2833  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.58 
 
 
492 aa  139  4e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0415  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.97 
 
 
284 aa  137  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0259  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  36.63 
 
 
514 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0777  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  34.32 
 
 
288 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0920  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.32 
 
 
288 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.815419  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1322  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.23 
 
 
276 aa  135  6e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0451  xanthine dehydrogenase small subunit  32.97 
 
 
496 aa  135  6e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608502  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2861  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.87 
 
 
488 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0406506  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2774  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  35.36 
 
 
291 aa  134  2e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3320  xanthine dehydrogenase  31.39 
 
 
490 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151633  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  32.23 
 
 
488 aa  133  4e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2837  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  35.93 
 
 
288 aa  132  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2224  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  35.42 
 
 
289 aa  132  7e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.844941  hitchhiker  0.000850669 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4257  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.87 
 
 
481 aa  131  1e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2680  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.41 
 
 
290 aa  130  2e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2144  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  33.21 
 
 
288 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3660  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  32.47 
 
 
484 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807153  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1334  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  35.19 
 
 
295 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1130  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35.27 
 
 
507 aa  129  4e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16283  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  32.6 
 
 
499 aa  129  4e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0029  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  32.84 
 
 
288 aa  128  9e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.275591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0552  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  33.58 
 
 
288 aa  128  1e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1035  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.19 
 
 
506 aa  127  1e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22588  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1167  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  32.72 
 
 
287 aa  127  2e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0713  xanthine dehydrogenase, small subunit  33.58 
 
 
512 aa  127  2e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.2 
 
 
468 aa  126  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0349  xanthine dehydrogenase, putative  32.12 
 
 
492 aa  125  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1676  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.48 
 
 
301 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.991973  normal  0.682256 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5002  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.29 
 
 
512 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2704  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.14 
 
 
487 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4273  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.5 
 
 
271 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4499  xanthine dehydrogenase small subunit  32.48 
 
 
496 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999061  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22290  xanthine dehydrogenase, small subunit  32.72 
 
 
496 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0365  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.75 
 
 
492 aa  123  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3041  xanthine dehydrogenase, small subunit  32.1 
 
 
515 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0266852 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2185  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.56 
 
 
292 aa  123  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.27538  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1815  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:[2Fe-2S]-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  31.85 
 
 
484 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522719  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2552  xanthine dehydrogenase, small subunit  33.7 
 
 
526 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.865646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3074  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  29.88 
 
 
294 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3389  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  33.58 
 
 
286 aa  122  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3924  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  32.48 
 
 
516 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2539  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  33.71 
 
 
287 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0444448  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3872  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.6 
 
 
285 aa  122  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2134  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein-like  33.95 
 
 
289 aa  121  1e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0711  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  32.48 
 
 
520 aa  120  2e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0728  xanthine dehydrogenase, small subunit  32.12 
 
 
527 aa  120  2e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1590  xanthine dehydrogenase, small subunit  32.73 
 
 
484 aa  120  2e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.597851 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4278  xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  32.73 
 
 
484 aa  121  2e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.513605  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0238  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.65 
 
 
278 aa  121  2e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0950  xanthine dehydrogenase, subunit A  30.63 
 
 
543 aa  121  2e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3604  xanthine dehydrogenase, small subunit  32.85 
 
 
484 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.703198  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3907  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.88 
 
 
542 aa  119  4e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1797  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.87 
 
 
484 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.014868  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0348  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.39 
 
 
528 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0658875  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0832  2Fe-2S ferredoxin, iron-sulfur binding site  31.39 
 
 
528 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0804  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.39 
 
 
523 aa  118  8e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3102  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.18 
 
 
507 aa  118  1e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238239  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2424  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  29.6 
 
 
480 aa  117  2e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2300  xanthine dehydrogenase small subunit  35.16 
 
 
476 aa  117  2e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289203  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3842  xanthine dehydrogenase, small subunit  32 
 
 
484 aa  117  2e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.977655  normal  0.775119 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0860  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.5 
 
 
504 aa  117  2e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4736  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  35.04 
 
 
296 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0767  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  28.98 
 
 
281 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00225703 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2422  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.39 
 
 
505 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2448  xanthine dehydrogenase, small subunit  33.82 
 
 
507 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0448  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.56 
 
 
282 aa  116  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.221209  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4236  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.71 
 
 
285 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1789  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.83 
 
 
484 aa  115  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02515  putative xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  31.39 
 
 
480 aa  115  7e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2095  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  31.37 
 
 
516 aa  114  2e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3948  hypothetical protein  31.23 
 
 
485 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.804932  normal  0.121566 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3595  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.16 
 
 
288 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>