More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2356 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2356  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 94 aa  186  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0238  histone family protein DNA-binding protein  71.11 
 
 		 91 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0180  histone family protein DNA-binding protein  70 
 
 		 91 aa  137  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75268  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2302  histone family protein DNA-binding protein  65.22 
 
 		 97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1888  histone family protein DNA-binding protein  65.22 
 
 		 93 aa  128  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000630839  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3754  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 101 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.159868  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1872  histone family protein DNA-binding protein  59.34 
 
 		 94 aa  121  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1996  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 92 aa  120  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2224  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 92 aa  120  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000923552 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2622  histone family protein DNA-binding protein  59.78 
 
 		 92 aa  120  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2120  integration host factor, alpha subunit  60 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1521  integration host factor, alpha subunit  61.11 
 
 		 91 aa  117  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.43426  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1417  histone-like DNA-binding protein  58.89 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000053245  normal  0.466182 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1424  integration host factor, alpha subunit  58.89 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000184784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1994  integration host factor subunit alpha  57.61 
 
 		 113 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1909  integration host factor subunit alpha  57.61 
 
 		 113 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1969  integration host factor subunit alpha  57.14 
 
 		 113 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0019696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1918  histone family protein DNA-binding protein  55.43 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000225021  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3742  integration host factor, alpha subunit  58.7 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal  0.554438 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1886  integration host factor, alpha subunit  56.67 
 
 		 99 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067674 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3685  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 93 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.166156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2837  integration host factor, alpha subunit  48.89 
 
 		 96 aa  98.6  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560391 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0268  integration host factor, alpha subunit  50 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1308  integration host factor, alpha subunit  48.89 
 
 		 96 aa  98.6  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3057  histone-like DNA-binding protein  52.22 
 
 		 97 aa  97.4  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.581982 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0092  integration host factor, alpha subunit  46.67 
 
 		 96 aa  96.7  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2066  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 96 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151573  normal  0.0307136 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0651  integration host factor, alpha subunit  48.39 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4386  integration host factor subunit alpha  48.35 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 94 aa  95.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  48.86 
 
 		 91 aa  94.4  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3378  integration host factor, alpha subunit  45.74 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3967  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0228483 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6231  integration host factor, alpha subunit  48.39 
 
 		 104 aa  94  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.75949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7074  integration host factor, alpha subunit  48.35 
 
 		 105 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3056  histone-like DNA-binding protein  60 
 
 		 70 aa  93.6  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00216712  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0362  histone-like DNA-binding protein  49.45 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1731  integration host factor subunit alpha  50 
 
 		 98 aa  92.8  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.074622  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  47.73 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2055  histone family protein DNA-binding protein  46.81 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2016  histone family protein DNA-binding protein  46.81 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2207  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2330  histone family protein DNA-binding protein  46.81 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.45414 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2799  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2493  integration host factor subunit alpha  42.7 
 
 		 98 aa  91.3  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.044668  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2799  integration host factor subunit alpha  41.94 
 
 		 99 aa  90.9  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1957  histone-like DNA-binding protein  46.15 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000024611  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2752  histone-like DNA-binding protein  47.78 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0918  integration host factor, alpha subunit  44.09 
 
 		 99 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4630  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 119 aa  90.5  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00633863  normal  0.0311538 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1587  integration host factor subunit alpha  43.01 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.526192  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2994  integration host factor, alpha subunit  47.67 
 
 		 97 aa  90.5  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2591  integration host factor, alpha subunit  48.31 
 
 		 98 aa  90.5  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.3815  normal  0.0354419 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1522  integration host factor, alpha subunit  42.22 
 
 		 101 aa  90.1  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00263552  normal  0.735039 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0699  integration host factor, alpha subunit  46.51 
 
 		 110 aa  90.1  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.101642  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0087  histone family protein DNA-binding protein  52.75 
 
 		 91 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0002  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 95 aa  90.1  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  44.44 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2673  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.156087  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0238  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2108  integration host factor subunit alpha  44.09 
 
 		 111 aa  89.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.283165  normal  0.12287 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0913  integration host factor subunit alpha  44.94 
 
 		 100 aa  89.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  47.73 
 
 		 91 aa  90.1  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000211181  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3294  integration host factor, alpha subunit  45.74 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.13347 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1913  integration host factor subunit alpha  43.82 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.749601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1269  integration host factor subunit alpha  43.82 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.272817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3032  integration host factor subunit alpha  44.44 
 
 		 100 aa  88.6  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.814183  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000429798  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2611  integration host factor subunit alpha  43.82 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1031  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1604  integration host factor subunit alpha  46.51 
 
 		 99 aa  88.6  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316087  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3557  integration host factor subunit alpha  48.31 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1721  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 101 aa  88.2  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1583  integration host factor subunit alpha  45.35 
 
 		 101 aa  88.6  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1805  integration host factor, alpha subunit  45.35 
 
 		 102 aa  88.2  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1633  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1314  integration host factor, alpha subunit  46.51 
 
 		 100 aa  88.2  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1751  integration host factor, alpha subunit  45.65 
 
 		 113 aa  88.2  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0308436 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1408  integration host factor subunit alpha  43.33 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.422535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 91 aa  88.2  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2677  integration host factor subunit alpha  43.33 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00137939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2687  integration host factor subunit alpha  43.33 
 
 		 123 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3021  integration host factor subunit alpha  43.33 
 
 		 118 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2651  integration host factor subunit alpha  43.33 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.030982  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  45.45 
 
 		 91 aa  87.4  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1187  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  87.4  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>