97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2299 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  100 
 
 
809 aa  1664    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  52.93 
 
 
885 aa  392  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  43.72 
 
 
782 aa  343  7e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  47.88 
 
 
945 aa  343  7e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  40.94 
 
 
893 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  41.85 
 
 
895 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  32.76 
 
 
936 aa  319  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  25.77 
 
 
826 aa  165  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  30.4 
 
 
898 aa  130  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  30.4 
 
 
898 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  30.88 
 
 
898 aa  129  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  39.64 
 
 
741 aa  117  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  30.43 
 
 
724 aa  112  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  26.88 
 
 
742 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  26.21 
 
 
742 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  29.18 
 
 
820 aa  107  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  29.41 
 
 
719 aa  103  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  26.35 
 
 
656 aa  103  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  26.03 
 
 
663 aa  102  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  25.69 
 
 
742 aa  103  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  24.89 
 
 
731 aa  102  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  24.05 
 
 
639 aa  101  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  24.02 
 
 
639 aa  99.8  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  25.06 
 
 
650 aa  99  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  25.06 
 
 
650 aa  99.4  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  26 
 
 
785 aa  97.8  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  23.85 
 
 
639 aa  97.4  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  26.84 
 
 
725 aa  97.4  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  22.59 
 
 
761 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  22.59 
 
 
764 aa  96.7  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  25.89 
 
 
755 aa  96.3  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  22.59 
 
 
764 aa  95.9  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  22.45 
 
 
761 aa  95.1  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  24.35 
 
 
650 aa  95.5  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  24.35 
 
 
650 aa  94.7  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  23.87 
 
 
646 aa  94.7  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  24.56 
 
 
762 aa  94.4  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  22.91 
 
 
639 aa  94.4  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  24.67 
 
 
762 aa  94.4  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  23.67 
 
 
650 aa  93.6  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  26.4 
 
 
639 aa  92.8  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  26.12 
 
 
639 aa  92.8  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  25.6 
 
 
762 aa  92.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  23.77 
 
 
639 aa  91.7  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  23.76 
 
 
816 aa  90.9  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  26.12 
 
 
639 aa  90.1  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  27.3 
 
 
738 aa  89.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  23.03 
 
 
765 aa  89.4  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  23.17 
 
 
650 aa  88.6  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  30.54 
 
 
758 aa  87.8  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  24.74 
 
 
639 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  27.86 
 
 
731 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  23.58 
 
 
762 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  23.68 
 
 
639 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  26.3 
 
 
729 aa  87  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  27.39 
 
 
731 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  25.59 
 
 
764 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  25.49 
 
 
716 aa  84  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  26.18 
 
 
722 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  27.13 
 
 
724 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  26.9 
 
 
727 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  25.54 
 
 
720 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  26.56 
 
 
789 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  26.84 
 
 
735 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  30.23 
 
 
789 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  23.78 
 
 
653 aa  81.3  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  25 
 
 
745 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  23.04 
 
 
640 aa  79  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  30.23 
 
 
788 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  26.75 
 
 
730 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  31.03 
 
 
822 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  29.79 
 
 
778 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  25.76 
 
 
833 aa  77.4  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  31.35 
 
 
671 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  26.49 
 
 
730 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  26.49 
 
 
730 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  23.1 
 
 
729 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  25.58 
 
 
745 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  21.42 
 
 
766 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  30.23 
 
 
788 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  25 
 
 
741 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  23.46 
 
 
764 aa  74.7  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  30.26 
 
 
655 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  27 
 
 
770 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  25.29 
 
 
843 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  28.21 
 
 
671 aa  71.2  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  21.4 
 
 
754 aa  70.5  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  28.05 
 
 
667 aa  66.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  26.16 
 
 
656 aa  65.1  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  27.01 
 
 
660 aa  60.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  29.71 
 
 
714 aa  55.1  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0437  hypothetical protein  25.13 
 
 
791 aa  51.2  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0438  hypothetical protein  23.7 
 
 
791 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.398757  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  24.87 
 
 
1111 aa  48.5  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0409  hypothetical protein  24.77 
 
 
782 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  32.89 
 
 
857 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4161  hypothetical protein  28.1 
 
 
785 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0782432 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>