96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2292 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  100 
 
 
782 aa  1606    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  42.23 
 
 
895 aa  593  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  40.78 
 
 
893 aa  581  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  40.62 
 
 
936 aa  525  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  35.61 
 
 
885 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  32.2 
 
 
945 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  43.72 
 
 
809 aa  343  7e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  31.33 
 
 
826 aa  254  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  29.61 
 
 
731 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  28.52 
 
 
742 aa  210  6e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  28.01 
 
 
742 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  28.01 
 
 
742 aa  204  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  28.77 
 
 
762 aa  174  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  27.87 
 
 
820 aa  171  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  24.51 
 
 
639 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  24.57 
 
 
639 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  25.6 
 
 
639 aa  146  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  24.54 
 
 
639 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  25.21 
 
 
646 aa  143  9e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  25.42 
 
 
639 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  26 
 
 
741 aa  142  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  24.32 
 
 
639 aa  141  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  24.43 
 
 
640 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  24.68 
 
 
639 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  25 
 
 
639 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  24.5 
 
 
816 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  24.14 
 
 
639 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  30.91 
 
 
898 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  29.91 
 
 
898 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  29.98 
 
 
898 aa  135  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  25.49 
 
 
729 aa  125  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  23.53 
 
 
778 aa  122  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  24.29 
 
 
639 aa  120  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  27.24 
 
 
650 aa  120  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  28.44 
 
 
650 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  26.63 
 
 
650 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  26.83 
 
 
650 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  28.21 
 
 
650 aa  118  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  23.15 
 
 
789 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  26.22 
 
 
650 aa  114  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  24.28 
 
 
719 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  25 
 
 
656 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  24.5 
 
 
725 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  24.16 
 
 
663 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  24.68 
 
 
729 aa  108  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  22.84 
 
 
716 aa  108  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  22.58 
 
 
788 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  23.84 
 
 
788 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  23.44 
 
 
789 aa  107  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  24.15 
 
 
785 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  28.74 
 
 
724 aa  105  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  28.82 
 
 
822 aa  105  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  28.03 
 
 
745 aa  104  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  23.8 
 
 
764 aa  104  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  25.78 
 
 
765 aa  104  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  26.13 
 
 
655 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  23.92 
 
 
724 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  26.12 
 
 
730 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  25.95 
 
 
730 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  25.95 
 
 
730 aa  99.8  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  28.11 
 
 
731 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  23.69 
 
 
735 aa  99.8  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  23.44 
 
 
745 aa  99  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  23.93 
 
 
766 aa  99  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  24.22 
 
 
761 aa  98.6  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  24.22 
 
 
764 aa  98.6  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  24.22 
 
 
761 aa  98.6  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  24.22 
 
 
764 aa  98.2  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  23.81 
 
 
720 aa  97.8  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  25.16 
 
 
731 aa  97.8  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  23.5 
 
 
653 aa  97.8  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  25.8 
 
 
770 aa  96.3  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  24.26 
 
 
741 aa  95.9  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  24.38 
 
 
762 aa  95.1  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  24.87 
 
 
762 aa  95.1  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  23.18 
 
 
833 aa  95.1  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  25 
 
 
762 aa  94.7  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  28.32 
 
 
722 aa  94.4  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  25.94 
 
 
738 aa  92.8  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  25.07 
 
 
758 aa  92.8  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  26.87 
 
 
671 aa  91.7  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  26.85 
 
 
667 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  22.37 
 
 
727 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  23.37 
 
 
755 aa  82  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  21.77 
 
 
714 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  25.47 
 
 
656 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  24.25 
 
 
857 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  25.39 
 
 
764 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  26.64 
 
 
660 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  25.74 
 
 
843 aa  72  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3279  hypothetical protein  23.79 
 
 
854 aa  70.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  23.12 
 
 
671 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3353  hypothetical protein  23.36 
 
 
856 aa  70.1  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  21.36 
 
 
754 aa  67.8  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  24.57 
 
 
1111 aa  60.5  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2907  hypothetical protein  23.76 
 
 
793 aa  50.8  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>