More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2278 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0522  ATP-dependent RNA helicase RhlB  79.76 
 
 		 443 aa  676    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00923533  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3035  ATP-dependent RNA helicase RhlB  80.92 
 
 		 438 aa  653    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000379043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2278  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 452 aa  930    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.64228  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  75.77 
 
 		 475 aa  636    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000426275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0945  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  75.98 
 
 		 451 aa  664    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  73.08 
 
 		 490 aa  645    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2779  DEAD/DEAH box helicase domain protein  72.95 
 
 		 482 aa  646    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000517174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0735  DEAD helicase family protein  61.95 
 
 		 433 aa  512  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0356  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.14 
 
 		 432 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.73 
 
 		 440 aa  430  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2070  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.05 
 
 		 438 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514873  normal  0.181762 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03716  ATP-dependent RNA helicase RhlB  56.14 
 
 		 574 aa  415  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3674  ATP-dependent RNA helicase RhlB  55.64 
 
 		 574 aa  418  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2156  ATP-dependent RNA helicase RhlB  54.43 
 
 		 544 aa  414  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.37 
 
 		 430 aa  413  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0202  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.42 
 
 		 428 aa  412  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002096  ATP-dependent RNA helicase RhlB  48.07 
 
 		 439 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895445  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2245  ATP-dependent RNA helicase RhlB  55.09 
 
 		 544 aa  410  1e-113  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.298458  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0155  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.47 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4013  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.08 
 
 		 430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03658  ATP-dependent RNA helicase  50.12 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000314324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4197  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.12 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00222167  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4144  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.12 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03607  hypothetical protein  50.12 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000127308  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4205  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.6 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5213  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.12 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3996  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.12 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4290  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.12 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4223  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.12 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0291518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0399  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.53 
 
 		 436 aa  403  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0449  ATP-dependent RNA helicase RhlB  49.38 
 
 		 432 aa  403  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4195  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.12 
 
 		 421 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4141  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.12 
 
 		 421 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2582  DEAD/DEAH box helicase-like  51.57 
 
 		 431 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4005  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.6 
 
 		 421 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00596063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4244  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.12 
 
 		 421 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4126  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.12 
 
 		 421 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4141  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.12 
 
 		 421 aa  401  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0339  ATP-dependent RNA helicase RhlB  47.6 
 
 		 435 aa  398  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.181774  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0407  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.8 
 
 		 439 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3951  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.91 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3928  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.68 
 
 		 438 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2697  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.68 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4069  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.91 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.341266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0410  ATP-dependent RNA helicase RhlB  47.24 
 
 		 439 aa  396  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4303  ATP-dependent RNA helicase RhlB  49.88 
 
 		 421 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0431153  normal  0.722207 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0411  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.8 
 
 		 439 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3614  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.8 
 
 		 439 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0158  ATP-dependent RNA helicase RhlB  49.64 
 
 		 428 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00338  ATP-dependent RNA helicase RhlB  47.56 
 
 		 437 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3876  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.68 
 
 		 438 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.587664  hitchhiker  0.000145647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4109  ATP-dependent RNA helicase RhlB  45.83 
 
 		 435 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0297113  hitchhiker  0.000114369 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3215  ATP-dependent RNA helicase RhlB  45.41 
 
 		 439 aa  393  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00568  ATP-dependent RNA helicase RhlB  53.49 
 
 		 429 aa  393  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595668  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0461  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.54 
 
 		 434 aa  393  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.388345  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0514  ATP-dependent RNA helicase RhlB  45.01 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0317755 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3432  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.33 
 
 		 439 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0509  ATP-dependent RNA helicase RhlB  47.95 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0178  ATP-dependent RNA helicase RhlB  47.95 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4036  ATP-dependent RNA helicase RhlB  47.95 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.269062  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0174  ATP-dependent RNA helicase RhlB  49.22 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2643  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.69 
 
 		 533 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0174  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.64 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0146  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.54 
 
 		 434 aa  375  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00149472  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4221  ATP-dependent RNA helicase RhlB  48.67 
 
 		 421 aa  378  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0989994  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1776  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.29 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.66 
 
 		 464 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.536242  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4554  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.86 
 
 		 489 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3191  ATP-dependent RNA helicase RhlB  49.33 
 
 		 418 aa  363  4e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0902  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.6 
 
 		 483 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.169794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14040  ATP-dependent RNA helicase RhlB  47.12 
 
 		 507 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  0.0213445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1295  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.6 
 
 		 480 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4430  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.6 
 
 		 480 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1244  ATP-dependent RNA helicase RhlB  47.12 
 
 		 529 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11290  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.86 
 
 		 521 aa  359  5e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3565  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.34 
 
 		 482 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.36909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0971  ATP-dependent RNA helicase RhlB  47.2 
 
 		 492 aa  355  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.951762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0620  ATP-dependent RNA helicase RhlB  45.69 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.651173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1623  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.43 
 
 		 424 aa  345  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.216615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1070  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.13 
 
 		 483 aa  343  4e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1253  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.13 
 
 		 397 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0770  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.63 
 
 		 383 aa  340  4e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000481841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2119  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45 
 
 		 452 aa  335  7.999999999999999e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637401  hitchhiker  0.000114297 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0943  putative ATP-dependent RNA helicase  45.09 
 
 		 396 aa  324  2e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1474  DEAD/DEAH box helicase-like  45.09 
 
 		 384 aa  324  2e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.738757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.18 
 
 		 497 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0617  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.46 
 
 		 479 aa  313  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.028654 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.73 
 
 		 545 aa  312  6.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1028  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.23 
 
 		 441 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0361604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.14 
 
 		 492 aa  309  6.999999999999999e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1952  DEAD/DEAH box helicase-like  41.2 
 
 		 426 aa  309  8e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.62212 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  42.82 
 
 		 543 aa  308  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  42.74 
 
 		 398 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.2 
 
 		 513 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.28 
 
 		 571 aa  306  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.09 
 
 		 489 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  41.82 
 
 		 491 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.63 
 
 		 511 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1257  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.5 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.63 
 
 		 497 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>