94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2200 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2200  type I restriction-modification system specificity subunit  100 
 
 
461 aa  945    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.844306  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  37.9 
 
 
461 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0487  restriction modification system DNA specificity subunit  36.68 
 
 
438 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3571  hypothetical protein  36.3 
 
 
458 aa  226  8e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1366  hypothetical protein  32.29 
 
 
462 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1366  putative type I site-specific restriction-modification system, S subunit  33.73 
 
 
422 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0493853  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4472  restriction modification system DNA specificity subunit  49.76 
 
 
415 aa  215  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.270866  normal  0.0902542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6260  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.94 
 
 
441 aa  203  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  32.48 
 
 
428 aa  199  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19070  hypothetical protein  31.15 
 
 
425 aa  199  7e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0871344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1783  restriction modification system DNA specificity subunit  30.3 
 
 
448 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2682  putative restriction endonuclease S subunit  35.29 
 
 
400 aa  182  9.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.845062  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0277  hypothetical protein  32.02 
 
 
474 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1860  type I restriction enzyme, S subunit  29.42 
 
 
474 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0504746  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  28.86 
 
 
432 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  29.93 
 
 
422 aa  173  5e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0264  restriction modification system DNA specificity subunit  33.46 
 
 
407 aa  172  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1327  restriction modification system DNA specificity subunit  30.28 
 
 
431 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.280518 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1221  restriction modification system DNA specificity subunit  27.9 
 
 
463 aa  162  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2176  restriction modification system DNA specificity subunit  32.29 
 
 
444 aa  159  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.962317  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2268  putative type I restriction enzyme, S subunit  28.73 
 
 
457 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  26.16 
 
 
437 aa  150  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  28.12 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.04 
 
 
456 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2869  type I restriction-modification system, S subunit  26.9 
 
 
448 aa  146  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0947716  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1516  restriction modification system DNA specificity subunit  26.01 
 
 
395 aa  144  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.205219 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2688  restriction endonuclease S subunits-like  27.54 
 
 
487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.165356  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.97 
 
 
445 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  27.25 
 
 
429 aa  139  7.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0416  type I restriction-modification system S subunit  24.42 
 
 
457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0531711 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0796  restriction modification system DNA specificity domain  26.59 
 
 
441 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343889 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  26.56 
 
 
456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  25.39 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  25.88 
 
 
477 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1481  restriction endonuclease S subunits-like protein  24.89 
 
 
443 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  26.05 
 
 
464 aa  126  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  24.65 
 
 
413 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.42 
 
 
453 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0750  putative type I restriction-modification system  31.12 
 
 
436 aa  123  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.769779  normal  0.272821 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1064  type I restriction-modification  25.43 
 
 
453 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000898872  normal  0.027841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0193  type I restriction-modification system specificity determinant  26.77 
 
 
416 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  29.28 
 
 
458 aa  117  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0658  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.64 
 
 
473 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  28.87 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2607  restriction modification system DNA specificity subunit  23.9 
 
 
462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0640  restriction modification system DNA specificity subunit  24.3 
 
 
447 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.63 
 
 
462 aa  104  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2606  restriction modification system DNA specificity subunit  26.76 
 
 
429 aa  100  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.25 
 
 
427 aa  98.2  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  25.93 
 
 
429 aa  97.1  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  25.64 
 
 
451 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  30.53 
 
 
799 aa  89.7  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1551  type I restriction enzyme  32.98 
 
 
439 aa  86.7  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.6 
 
 
442 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0988  type I restriction-modification system, S subunit  21.45 
 
 
401 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0467  restriction modification system DNA specificity subunit  19.95 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0455  restriction modification system DNA specificity subunit  19.95 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2698  restriction modification system DNA specificity subunit  24 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0854775  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22810  hypothetical protein  22.27 
 
 
418 aa  72  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4455  restriction modification system DNA specificity subunit  22 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.353509  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  24.49 
 
 
442 aa  68.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  23.37 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1160  restriction modification system DNA specificity subunit  24.45 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  23.49 
 
 
425 aa  65.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1960  restriction endonuclease S subunit  21.22 
 
 
413 aa  60.5  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.323459  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2621  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.86 
 
 
400 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13680  hypothetical protein  22.16 
 
 
354 aa  53.5  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.247083  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0098  restriction endonuclease S subunits  22.71 
 
 
315 aa  53.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2689  restriction modification system DNA specificity subunit  24.34 
 
 
290 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  22.35 
 
 
439 aa  50.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  26.37 
 
 
435 aa  50.1  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03180  hypothetical protein  27.08 
 
 
159 aa  50.1  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000950219 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1091  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.18 
 
 
444 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  23.22 
 
 
425 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2346  restriction modification system DNA specificity subunit  22.89 
 
 
392 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104931  normal  0.0105772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1158  restriction modification system DNA specificity subunit  23.86 
 
 
454 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000117149  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0268  restriction endonuclease S subunits  28.93 
 
 
444 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277222  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4917  restriction modification system DNA specificity subunit  23.76 
 
 
412 aa  48.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.544675 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2277  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.96 
 
 
433 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  hitchhiker  0.00000677276 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1225  hypothetical protein  21.84 
 
 
459 aa  47  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.438073 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2378  type I restriction-modification system, S subunit  23.35 
 
 
383 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.1 
 
 
477 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  28.21 
 
 
611 aa  45.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184495 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0727  restriction modification system DNA specificity domain protein  19.76 
 
 
400 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0968972 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2009  restriction modification system DNA specificity domain  23.35 
 
 
423 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.999718  normal  0.91224 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  25.7 
 
 
435 aa  44.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  23.79 
 
 
402 aa  44.7  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6044  type I restriction-modification system subunit S  21.3 
 
 
547 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.061065  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  21.21 
 
 
453 aa  44.7  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  21.01 
 
 
429 aa  44.3  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  21.09 
 
 
426 aa  44.3  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  20.81 
 
 
422 aa  43.9  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1216  restriction modification system DNA specificity subunit  25.61 
 
 
427 aa  43.5  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3180  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.87 
 
 
390 aa  43.5  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>