36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2198 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2198  Appr-1-p processing domain protein  100 
 
 		 351 aa  723    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  69.97 
 
 		 345 aa  511  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  65.33 
 
 		 349 aa  494  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5541  Appr-1-p processing domain protein  69.46 
 
 		 357 aa  491  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0161  appr-1-p processing domain-containing protein  64.84 
 
 		 353 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133487  decreased coverage  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  64.83 
 
 		 354 aa  465  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  62.43 
 
 		 346 aa  464  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  45.94 
 
 		 351 aa  323  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2099  Appr-1-p processing domain protein  45.82 
 
 		 345 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167345  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  45.37 
 
 		 331 aa  299  6e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1468  hypothetical protein  43.23 
 
 		 353 aa  296  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  41.74 
 
 		 362 aa  266  4e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10059  hypothetical protein  41.67 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2281899999999994e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1810  Appr-1-p processing enzyme  60.09 
 
 		 254 aa  261  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.12645  normal  0.175893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0910  appr-1-p processing domain-containing protein  42.81 
 
 		 356 aa  243  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.998324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0862  Appr-1-p processing domain protein  40.12 
 
 		 355 aa  236  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0566  appr-1-p processing domain-containing protein  37.88 
 
 		 360 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315958  decreased coverage  0.00000000000000126999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5129  hypothetical protein  40.32 
 
 		 362 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1715  appr-1-p processing domain-containing protein  37.58 
 
 		 397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00091392  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  32.59 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2355  appr-1-p processing domain-containing protein  46.98 
 
 		 150 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1300  hypothetical protein  45.61 
 
 		 136 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1660  Appr-1-p processing domain protein  41.79 
 
 		 242 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000103868  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0073  hypothetical protein  32.91 
 
 		 393 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000146563  unclonable  0.00000000120063 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1158  hypothetical protein  31.45 
 
 		 392 aa  86.7  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4398  Appr-1-p processing domain protein  30 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2730  Appr-1-p processing domain protein  26.87 
 
 		 163 aa  67.4  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000300309  hitchhiker  0.00298668 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4411  Appr-1-p processing domain protein  32.12 
 
 		 152 aa  67  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0142  hypothetical protein  27.92 
 
 		 158 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41970  hypothetical protein  26.42 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3562  hypothetical protein  26.42 
 
 		 168 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1160  appr-1-p processing domain-containing protein  27.52 
 
 		 167 aa  50.4  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.429654  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2786  Appr-1-p processing  26.19 
 
 		 152 aa  50.4  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3357  Appr-1-p processing domain protein  29.23 
 
 		 162 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0960  Appr-1-p processing  27.46 
 
 		 179 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3196  Appr-1-p processing domain protein  24 
 
 		 165 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>