41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2125 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2125  response regulator receiver protein  100 
 
 		 332 aa  662    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.551228  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2224  response regulator  42.94 
 
 		 561 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1728  response regulator receiver protein  42.55 
 
 		 532 aa  226  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3148  response regulator receiver protein  43.37 
 
 		 567 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0753  response regulator receiver protein  34.06 
 
 		 604 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0738  response regulator receiver protein  48.78 
 
 		 592 aa  152  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2313  hypothetical protein  45.68 
 
 		 394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0309  hypothetical protein  37.11 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1407  two component signal transduction response regulator  27.94 
 
 		 535 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.301993  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2714  hypothetical protein  27.09 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0064  hypothetical protein  31.75 
 
 		 898 aa  65.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2722  hypothetical protein  31.85 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2814  hypothetical protein  31.11 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0508779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2906  hypothetical protein  31.11 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2965  hypothetical protein  26.49 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0261  response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 		 581 aa  59.3  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0296157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2030  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 597 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351446  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4041  hypothetical protein  29.63 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0231  hypothetical protein  25.67 
 
 		 591 aa  57  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.305258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4184  hypothetical protein  29.03 
 
 		 366 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4157  hypothetical protein  29.03 
 
 		 366 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0845  hypothetical protein  30 
 
 		 273 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4052  two component transcriptional regulator, Fis family  31.58 
 
 		 182 aa  49.3  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444391  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2497  sporulation transcriptional activator Spo0A  30.7 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0191  response regulator receiver protein  24.48 
 
 		 570 aa  47  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2398  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.18 
 
 		 469 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.313034  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0387  hypothetical protein  27.78 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.527792  hitchhiker  0.000473152 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2310  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.18 
 
 		 469 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294968  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3241  response regulator  32.86 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0406645  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 467 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1013  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30 
 
 		 456 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1771  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 		 613 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228361 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2258  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 468 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428008  normal  0.0222917 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0173  response regulator receiver protein  24.42 
 
 		 570 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000162346 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1395  hypothetical protein  26.67 
 
 		 600 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4899  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 607 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  0.0631454 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1731  hypothetical protein  30 
 
 		 273 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3087  response regulator receiver protein  28.44 
 
 		 269 aa  43.5  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000156547  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0214  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 455 aa  43.1  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.662344 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3768  hypothetical protein  25.6 
 
 		 424 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  35.29 
 
 		 357 aa  42.4  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>