72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2109 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  100 
 
 		 835 aa  1706    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1128  hypothetical protein  36.13 
 
 		 367 aa  163  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  33.16 
 
 		 331 aa  99.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.22 
 
 		 726 aa  96.3  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1455  M6 family metalloprotease domain protein  40.65 
 
 		 998 aa  89  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00413675  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  33.33 
 
 		 2117 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  47.13 
 
 		 1011 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  36.05 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  35.83 
 
 		 608 aa  81.3  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  34.08 
 
 		 2002 aa  77  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  35.19 
 
 		 720 aa  77  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2340  peptidase C10 streptopain  36.99 
 
 		 845 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2147  spore coat protein H  29.82 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1501  peptidase-like  38.26 
 
 		 1376 aa  73.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  46.59 
 
 		 1022 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2046  spore coat protein H  28.82 
 
 		 358 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1899  spore coat protein H  28.82 
 
 		 368 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2115  spore coat protein H  29.39 
 
 		 358 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196151  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  32.05 
 
 		 514 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1852  spore coat protein H  28.95 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2078  spore coat protein H  28.95 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1862  spore coat protein H  28.95 
 
 		 368 aa  72  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  43.43 
 
 		 635 aa  72  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  29.61 
 
 		 864 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  43.43 
 
 		 635 aa  71.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2204  PKD  42.42 
 
 		 634 aa  71.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1857  hypothetical protein  32.51 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000442866  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  42.45 
 
 		 706 aa  70.5  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2036  spore coat protein H  27.75 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1896  spore coat protein CotH  27.75 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3273  spore coat protein H  28.51 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0475  spore coat assembly protein-like protein  26.01 
 
 		 569 aa  66.6  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0157813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1498  spore coat protein (inner)  27.12 
 
 		 364 aa  66.2  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  35.53 
 
 		 1027 aa  65.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2586  hypothetical protein  30.41 
 
 		 582 aa  65.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0849456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1457  hypothetical protein  34.67 
 
 		 940 aa  65.1  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000415379  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1535  spore coat protein CotH  26.43 
 
 		 358 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  33.11 
 
 		 1081 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  35.29 
 
 		 1095 aa  62.4  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  29.32 
 
 		 533 aa  62.4  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2048  Spore coat protein CotH  27.31 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159417  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  35.56 
 
 		 1004 aa  59.7  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4525  Parallel beta-helix repeat protein  42.47 
 
 		 488 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000043731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0603  hypothetical protein  43.24 
 
 		 1090 aa  59.3  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6689  Spore coat protein CotH  22.82 
 
 		 500 aa  58.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3722  hypothetical protein  43.01 
 
 		 1390 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  46.43 
 
 		 1263 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2962  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.28 
 
 		 351 aa  55.1  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0739  spore coat assembly protein-like protein  23.69 
 
 		 495 aa  55.1  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  41.43 
 
 		 1222 aa  55.1  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1458  M6 family metalloprotease domain protein  40.88 
 
 		 1004 aa  54.7  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000451067  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2338  peptidase C10 streptopain  31.82 
 
 		 841 aa  54.7  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193161  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0099  spore coat protein CotH  22.96 
 
 		 610 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158821 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.87 
 
 		 1323 aa  52.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  36.99 
 
 		 826 aa  52.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  42.25 
 
 		 4357 aa  51.2  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3452  hypothetical protein  37.18 
 
 		 719 aa  51.6  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153341  normal  0.241088 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.81 
 
 		 607 aa  51.2  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  37.18 
 
 		 1076 aa  50.8  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1492  spore coat protein CotH  23.79 
 
 		 564 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000146602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1456  hypothetical protein  36.36 
 
 		 792 aa  50.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.158395  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2822  spore coat assembly protein-like  28.95 
 
 		 567 aa  50.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5246  hypothetical protein  35.56 
 
 		 708 aa  48.5  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.733129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  27.68 
 
 		 1303 aa  48.1  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1601 aa  48.1  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1872  hypothetical protein  31.37 
 
 		 848 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0860464 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 2082 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  34.55 
 
 		 3197 aa  47  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  40.23 
 
 		 1310 aa  46.6  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  40.23 
 
 		 1035 aa  46.6  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2053  cell wall hydrolase/autolysin  22.11 
 
 		 1805 aa  46.2  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0944143  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  42.37 
 
 		 833 aa  45.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>