More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2096 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  100 
 
 		 70 aa  141  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1496  pilin domain-containing protein  80.88 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232938  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1656  pilin domain-containing protein  74.29 
 
 		 74 aa  88.6  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000269442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1636  pilin domain-containing protein  72.46 
 
 		 74 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1399  N-terminal methylation  69.57 
 
 		 69 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.427035 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2590  pilin domain protein  68.57 
 
 		 76 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2677  hypothetical protein  67.16 
 
 		 203 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  51.47 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  49.21 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  50 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  50.79 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  68.09 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  44.78 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2153  competence protein  37.88 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0605499  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.18 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  47.62 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  46.77 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  52.54 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1319  secretory protein  41.18 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0113151 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  44.44 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2144  pilus-related protein, putative  60.61 
 
 		 196 aa  57.4  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.19 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  46.03 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  50.85 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  65.22 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  47.46 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  44.07 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  42.86 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  35.94 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  39.39 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  42.65 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  37.68 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  78.12 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  42.86 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  45.61 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  41.18 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  40 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  40 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  43.75 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  50.85 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  58.7 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  54.9 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  67.5 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  65.79 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.03 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  52.94 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  54.55 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  53.06 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  67.57 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  47.62 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  46.88 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  49.06 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  49.15 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.85 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004288  putative fimbrial assembly protein PilE  50 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  42.62 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.67 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  60.78 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  45.31 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  55.93 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  75.76 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  38.1 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  50 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  80 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  41.54 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  40.68 
 
 		 149 aa  52  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  36.51 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  49.15 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  66.67 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  56.25 
 
 		 160 aa  51.6  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  36.76 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  36.76 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  82.14 
 
 		 175 aa  51.6  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  46.03 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  40.98 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  48.48 
 
 		 170 aa  51.2  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  41.67 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  57.14 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.85 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  70 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  42.62 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  47.83 
 
 		 208 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  45.76 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  34.43 
 
 		 137 aa  50.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  52.83 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  46.97 
 
 		 196 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.62 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  71.88 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_002936  DET0134  hypothetical protein  38.1 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  40.74 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  44.26 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.98 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  45.76 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  37.7 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  65.62 
 
 		 174 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  40.74 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  39.71 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  40.74 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>