More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2066 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2066  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 257 aa  522  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.585101  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 543 aa  82  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 1276 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.94 
 
 		 632 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 465 aa  72  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  31.03 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 1371 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.44 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 		 4079 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 562 aa  69.7  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 393 aa  68.6  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.74 
 
 		 1979 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1618  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 878 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 927 aa  66.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 1421 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 592 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.02 
 
 		 758 aa  65.9  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.61 
 
 		 1694 aa  65.5  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.86 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.83 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 602 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.58 
 
 		 810 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.04 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  26.89 
 
 		 626 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 614 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  26.89 
 
 		 614 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 614 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  26.89 
 
 		 626 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  26.89 
 
 		 614 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 935 aa  63.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 689 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1345  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25.4 
 
 		 576 aa  62.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  22.96 
 
 		 577 aa  62.4  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  22.96 
 
 		 577 aa  62.4  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  23.16 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 3560 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.5 
 
 		 784 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  29.55 
 
 		 864 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  26.83 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.11 
 
 		 626 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 4489 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 1005 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 718 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 614 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  21.84 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  27.69 
 
 		 1138 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 523 aa  59.7  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1641  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.3 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.94 
 
 		 2240 aa  60.1  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 620 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  25.56 
 
 		 503 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.75 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  27.23 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4138  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 615 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1184  TPR domain-containing protein  26.52 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  25.89 
 
 		 620 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 3035 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 522 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 955 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  27.69 
 
 		 1240 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.28 
 
 		 725 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  22.87 
 
 		 581 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4290  TPR domain-containing protein  25.42 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4127  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0499017  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 542 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  30.33 
 
 		 623 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4624  TPR domain-containing protein  25.42 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4475  TPR domain protein  25.42 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000190548 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 617 aa  57.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0721  TPR domain protein  25.42 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 3145 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  29.08 
 
 		 587 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4515  TPR domain protein  25.42 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4478  TPR domain-containing protein  25.42 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.404717  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 602 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4528  TPR domain protein  25.42 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000798973  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 762 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  27.88 
 
 		 1067 aa  57  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 		 1737 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  25.19 
 
 		 564 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 750 aa  57  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 366 aa  57  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  25.98 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>