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for query gene Glov_2006 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 586 aa  1181    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.01 
 
 		 568 aa  630  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.76 
 
 		 573 aa  548  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.87 
 
 		 578 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  49.82 
 
 		 578 aa  535  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.31 
 
 		 569 aa  518  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.37 
 
 		 574 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.09 
 
 		 885 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.72 
 
 		 599 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.85 
 
 		 827 aa  434  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.66 
 
 		 907 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.29 
 
 		 811 aa  422  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.98 
 
 		 573 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.93 
 
 		 814 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.98 
 
 		 573 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.35 
 
 		 564 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.78 
 
 		 831 aa  409  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.96 
 
 		 572 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  39.66 
 
 		 592 aa  406  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  35.73 
 
 		 574 aa  404  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.62 
 
 		 801 aa  398  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.76 
 
 		 570 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.41 
 
 		 572 aa  388  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
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NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.15 
 
 		 568 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550153 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.21 
 
 		 779 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.21 
 
 		 779 aa  385  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  37.21 
 
 		 779 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.04 
 
 		 773 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.04 
 
 		 779 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
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NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  37.04 
 
 		 779 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.51 
 
 		 779 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.94 
 
 		 573 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.68 
 
 		 779 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.34 
 
 		 587 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.86 
 
 		 779 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  38.25 
 
 		 932 aa  381  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.86 
 
 		 779 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.86 
 
 		 779 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013162  Coch_0347  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.57 
 
 		 564 aa  375  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.11 
 
 		 798 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  35.56 
 
 		 566 aa  374  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
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NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.4 
 
 		 574 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
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NC_013223  Dret_0292  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.76 
 
 		 577 aa  375  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.24 
 
 		 570 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.94 
 
 		 788 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.06 
 
 		 785 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.54 
 
 		 584 aa  365  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  35.07 
 
 		 568 aa  365  2e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.24 
 
 		 579 aa  365  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
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NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.48 
 
 		 568 aa  363  4e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.37 
 
 		 989 aa  363  7.0000000000000005e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.43 
 
 		 566 aa  362  1e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.32 
 
 		 571 aa  360  4e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_1134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.45 
 
 		 571 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.37 
 
 		 977 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.68 
 
 		 566 aa  356  7.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_3186  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.55 
 
 		 846 aa  353  2.9999999999999997e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28913  normal  1 
 
 
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NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.68 
 
 		 570 aa  353  5.9999999999999994e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
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NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.28 
 
 		 1035 aa  351  2e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_4073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.79 
 
 		 864 aa  350  5e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00138727  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.38 
 
 		 573 aa  350  5e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
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NC_013061  Phep_3683  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.22 
 
 		 567 aa  347  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.96 
 
 		 592 aa  345  1e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_1209  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.24 
 
 		 955 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00300001  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.4 
 
 		 566 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.39 
 
 		 568 aa  343  4e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.01 
 
 		 584 aa  343  5e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009943  Dole_2106  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.19 
 
 		 573 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00306237  n/a   
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.09 
 
 		 732 aa  342  1e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_2871  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.3 
 
 		 654 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007404  Tbd_1771  exonuclease RecJ  38.95 
 
 		 565 aa  341  2e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.495895  normal  0.722264 
 
 
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NC_007519  Dde_2715  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.42 
 
 		 568 aa  342  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.036762  n/a   
 
 
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NC_008261  CPF_2322  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.57 
 
 		 592 aa  342  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_4751  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.22 
 
 		 626 aa  341  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009901  Spea_0807  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.17 
 
 		 574 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0051  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.25 
 
 		 579 aa  340  4e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.458674  normal  0.205446 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1246  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.23 
 
 		 955 aa  340  4e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000605261  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.33 
 
 		 589 aa  340  5e-92  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1409  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.69 
 
 		 578 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0667264  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2948  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.97 
 
 		 603 aa  337  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181074  hitchhiker  0.00226197 
 
 
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NC_008639  Cpha266_0687  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.14 
 
 		 574 aa  336  7e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449163  n/a   
 
 
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NC_013515  Smon_0080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.34 
 
 		 883 aa  335  1e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008527  LACR_0656  exonuclease RecJ  35.97 
 
 		 742 aa  335  1e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.48 
 
 		 579 aa  333  4e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_0378  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.89 
 
 		 865 aa  332  9e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_2787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.35 
 
 		 613 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.36 
 
 		 610 aa  332  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.553946 
 
 
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NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  34.6 
 
 		 584 aa  331  2e-89  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_1213  exonuclease RecJ  36.32 
 
 		 581 aa  331  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011060  Ppha_2206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.2 
 
 		 573 aa  331  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133994  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2813  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.54 
 
 		 613 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0113123  normal  1 
 
 
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NC_008531  LEUM_1474  single-stranded DNA-specific exonuclease  35.08 
 
 		 655 aa  330  4e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.98 
 
 		 583 aa  330  6e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002620  TC0732  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.2 
 
 		 582 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.213373  n/a   
 
 
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NC_008309  HS_1474  single-strand DNA-specific exonuclease  39.48 
 
 		 573 aa  328  2.0000000000000001e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_1681  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.94 
 
 		 911 aa  327  4.0000000000000003e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.674318  normal  0.0670138 
 
 
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NC_010084  Bmul_1154  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.25 
 
 		 565 aa  327  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0447096 
 
 
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NC_007964  Nham_2307  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.48 
 
 		 613 aa  326  7e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013165  Shel_21910  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.41 
 
 		 1102 aa  326  7e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0138959 
 
 
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NC_007492  Pfl01_1035  exonuclease RecJ  36.72 
 
 		 569 aa  326  9e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
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