More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1955 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  100 
 
 
354 aa  720    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  64.87 
 
 
361 aa  423  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  58.4 
 
 
363 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  56.76 
 
 
367 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  48.2 
 
 
357 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  49.21 
 
 
371 aa  300  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
364 aa  133  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  28.48 
 
 
330 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.34 
 
 
359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  28.61 
 
 
367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.01 
 
 
516 aa  126  7e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1756  glycosyl transferase family 9  29.46 
 
 
386 aa  125  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0677074  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.77 
 
 
360 aa  123  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
379 aa  122  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0907  glycosyl transferase family 9  27.9 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.6 
 
 
368 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.98 
 
 
343 aa  119  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.23 
 
 
339 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.74 
 
 
362 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.05 
 
 
348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  27.88 
 
 
341 aa  116  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
347 aa  116  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  28.88 
 
 
344 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3715  hypothetical protein  26.56 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.43 
 
 
359 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
344 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.59 
 
 
352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  27.91 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  27.91 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.94 
 
 
343 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  28.12 
 
 
356 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
406 aa  106  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.01 
 
 
352 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  29.57 
 
 
352 aa  105  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  29.57 
 
 
352 aa  105  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  29.57 
 
 
352 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0670  ADP-heptoselps heptosyltransferase  27.86 
 
 
365 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.374437  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.17 
 
 
389 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  29.7 
 
 
352 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  29.57 
 
 
352 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1968  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  27.27 
 
 
388 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.78963  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.95 
 
 
361 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  30 
 
 
340 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  30 
 
 
340 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0577  heptosyltransferase family protein  27.57 
 
 
365 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  30 
 
 
340 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0585  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
406 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.11 
 
 
332 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  24.42 
 
 
330 aa  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1977  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase, putative  27.35 
 
 
365 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
348 aa  102  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.75 
 
 
367 aa  102  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  22.62 
 
 
354 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  26.43 
 
 
360 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.43 
 
 
332 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.43 
 
 
332 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
358 aa  99.4  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 
403 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.09 
 
 
356 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.09 
 
 
356 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.09 
 
 
356 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.09 
 
 
356 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  28.67 
 
 
356 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2822  glycosyl transferase family 9  28.57 
 
 
357 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0009  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.35 
 
 
349 aa  97.1  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
302 aa  96.7  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0977  glycosyl transferase family 9  30.6 
 
 
336 aa  96.7  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.412214  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.85 
 
 
361 aa  96.7  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  26.93 
 
 
349 aa  96.3  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.49 
 
 
346 aa  96.3  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  26.98 
 
 
340 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.48 
 
 
360 aa  95.9  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3478  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.35 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  27.76 
 
 
356 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2022  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.82 
 
 
345 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2633  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.82 
 
 
345 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609317  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2553  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.82 
 
 
345 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  26.38 
 
 
349 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  24.16 
 
 
373 aa  93.6  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0665  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.82 
 
 
345 aa  94  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0789  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.65 
 
 
335 aa  93.6  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
318 aa  93.6  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  24.16 
 
 
356 aa  93.2  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  23.56 
 
 
404 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
326 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  25.59 
 
 
392 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2616  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.7 
 
 
346 aa  93.2  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 
336 aa  92.8  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3628  glycosyl transferase family 9  28.42 
 
 
362 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1069  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.09 
 
 
356 aa  92  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0576  glycosyl transferase family protein  25.07 
 
 
331 aa  92.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3702  glycosyl transferase family 9  28.42 
 
 
408 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  23.56 
 
 
402 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.69 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.32 
 
 
349 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  30.74 
 
 
381 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  25.8 
 
 
349 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  25.59 
 
 
475 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
323 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  30.74 
 
 
381 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>