More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1949 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  77.12 
 
 		 509 aa  846    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  80.12 
 
 		 510 aa  883    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  79.29 
 
 		 509 aa  867    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  78.9 
 
 		 509 aa  862    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 508 aa  1062    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  72.16 
 
 		 511 aa  779    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  80.67 
 
 		 509 aa  892    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  79.41 
 
 		 506 aa  871    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  57.06 
 
 		 632 aa  628  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  58.43 
 
 		 516 aa  617  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 		 648 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  55.84 
 
 		 651 aa  613  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 		 653 aa  611  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  56.84 
 
 		 650 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 		 653 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  56.67 
 
 		 518 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 512 aa  604  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 		 645 aa  604  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 		 533 aa  600  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 		 647 aa  597  1e-169  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  55.49 
 
 		 654 aa  596  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 		 655 aa  590  1e-167  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 		 650 aa  586  1e-166  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 645 aa  579  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  53.44 
 
 		 645 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 647 aa  571  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  54.25 
 
 		 660 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 		 660 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 		 660 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 		 660 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 660 aa  560  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  53.74 
 
 		 660 aa  559  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  54.25 
 
 		 660 aa  561  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  54.25 
 
 		 660 aa  560  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  53.74 
 
 		 660 aa  559  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 		 519 aa  560  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  53.74 
 
 		 660 aa  560  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  54.24 
 
 		 628 aa  556  1e-157  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 659 aa  556  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 645 aa  554  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 		 656 aa  550  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 634 aa  547  1e-154  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 657 aa  544  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 657 aa  544  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 629 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 		 650 aa  538  9.999999999999999e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 629 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 		 638 aa  535  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 511 aa  528  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 634 aa  526  1e-148  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0029  methionyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 512 aa  523  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.743063  normal  0.0950714 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  50.78 
 
 		 640 aa  523  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 648 aa  519  1e-146  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 636 aa  519  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 665 aa  518  1.0000000000000001e-145  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1583  methionyl-tRNA synthetase  50.19 
 
 		 517 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2079  methionyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 		 515 aa  509  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87065  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1459  methionyl-tRNA synthetase  49.81 
 
 		 500 aa  509  1e-143  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0995  methionyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 		 515 aa  507  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0962  methionyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 		 515 aa  507  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933149  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 		 642 aa  508  9.999999999999999e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 		 514 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  49.02 
 
 		 574 aa  499  1e-140  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1065  methionyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 		 644 aa  499  1e-140  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.241007  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1534  methionyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 530 aa  498  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.410628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 671 aa  501  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 666 aa  500  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4100  methionyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 722 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.631035  normal  0.0384097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1990  methionyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 516 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.950976  hitchhiker  0.0073495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2681  methionyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 514 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 530 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1462  methionyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 544 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 538 aa  494  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2705  methionyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 522 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 675 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2008  methionyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 659 aa  495  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0838931  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1802  methionyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 		 516 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0193813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2533  methionyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 519 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308491  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4327  methionyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 550 aa  491  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3113  methionyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 520 aa  490  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2717  methionyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 514 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0359  methionyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 		 493 aa  488  1e-137  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 654 aa  491  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 681 aa  490  1e-137  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1490  methionyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 523 aa  491  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3236  methionyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 516 aa  489  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 663 aa  489  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2273  methionyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 		 519 aa  490  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000444544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6468  methionyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 515 aa  487  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 667 aa  485  1e-136  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4803  methionyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 511 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 		 664 aa  483  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1514  methionyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 525 aa  482  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 657 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1930  methionyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 514 aa  482  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4034  methionyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 535 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.461216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07450  methionyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 526 aa  481  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.988423 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3992  methionyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 535 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4266  methionyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 515 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.345625  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4645  methionyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 515 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.975298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>