More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1910 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  85.85 
 
 		 433 aa  786    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  85.85 
 
 		 433 aa  758    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  84.22 
 
 		 434 aa  771    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  85.19 
 
 		 433 aa  778    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 436 aa  904    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  84.72 
 
 		 433 aa  775    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  84.65 
 
 		 435 aa  772    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  60.7 
 
 		 432 aa  559  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  60.47 
 
 		 433 aa  557  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  60.47 
 
 		 432 aa  554  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  60 
 
 		 439 aa  549  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  57.87 
 
 		 433 aa  545  1e-154  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  57.77 
 
 		 432 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  56.94 
 
 		 433 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  58.6 
 
 		 441 aa  536  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  57.91 
 
 		 433 aa  536  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  59.07 
 
 		 433 aa  537  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  57.08 
 
 		 432 aa  535  1e-151  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  57.54 
 
 		 432 aa  537  1e-151  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  57.87 
 
 		 434 aa  536  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  56.84 
 
 		 432 aa  535  1e-151  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  57.21 
 
 		 433 aa  533  1e-150  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  59.08 
 
 		 433 aa  533  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  58.6 
 
 		 433 aa  533  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  59.95 
 
 		 433 aa  531  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  56.48 
 
 		 433 aa  534  1e-150  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  57.77 
 
 		 435 aa  530  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  56.41 
 
 		 432 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  58.28 
 
 		 433 aa  529  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  58.64 
 
 		 435 aa  526  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  58.53 
 
 		 435 aa  526  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  57.34 
 
 		 430 aa  525  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  57.91 
 
 		 434 aa  526  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  57.91 
 
 		 434 aa  525  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  55.68 
 
 		 431 aa  526  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  56.05 
 
 		 436 aa  521  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  57.21 
 
 		 433 aa  522  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  58.1 
 
 		 433 aa  522  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  55.92 
 
 		 433 aa  518  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  57.37 
 
 		 434 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  58.14 
 
 		 434 aa  518  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  59.16 
 
 		 432 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  56.51 
 
 		 434 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  58.16 
 
 		 438 aa  511  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  55.45 
 
 		 433 aa  512  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  60.47 
 
 		 428 aa  512  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  55.66 
 
 		 437 aa  512  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  56.15 
 
 		 433 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  56.18 
 
 		 432 aa  510  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  56.71 
 
 		 437 aa  511  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  55.81 
 
 		 434 aa  503  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  54.76 
 
 		 433 aa  496  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  55.32 
 
 		 435 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  53.95 
 
 		 435 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  54.52 
 
 		 446 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  52.66 
 
 		 439 aa  486  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  52.66 
 
 		 439 aa  487  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  52.19 
 
 		 439 aa  486  1e-136  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  54.42 
 
 		 444 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  54.65 
 
 		 432 aa  480  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  53.49 
 
 		 444 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  53.02 
 
 		 444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  51.3 
 
 		 423 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  54.61 
 
 		 446 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  52.42 
 
 		 443 aa  463  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  54.48 
 
 		 432 aa  464  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  54.48 
 
 		 434 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  53.52 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  52.67 
 
 		 441 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  54.01 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  54.25 
 
 		 432 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  51.86 
 
 		 437 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  54.48 
 
 		 432 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  53.77 
 
 		 432 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  54.48 
 
 		 432 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1585  Phenylacetate--CoA ligase  51.03 
 
 		 457 aa  455  1e-127  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0730683 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  53.18 
 
 		 441 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  52.59 
 
 		 441 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  52.59 
 
 		 441 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  53.92 
 
 		 433 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  53.27 
 
 		 439 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  52.36 
 
 		 431 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  52.94 
 
 		 441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  51.54 
 
 		 445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  50.23 
 
 		 442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  53.3 
 
 		 432 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0838  phenylacetate--CoA ligase  51.04 
 
 		 431 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  52.24 
 
 		 441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  53.54 
 
 		 434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  53.18 
 
 		 441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  52.71 
 
 		 436 aa  448  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3568  phenylacetate-CoA ligase  52.86 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172482  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  52.86 
 
 		 432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  51.41 
 
 		 444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  54.57 
 
 		 438 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0440  phenylacetate-CoA ligase  50.24 
 
 		 436 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3550  phenylacetate-CoA ligase  53.1 
 
 		 432 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489447  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3577  phenylacetate-CoA ligase  53.1 
 
 		 432 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306139  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  50.58 
 
 		 433 aa  444  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0638  phenylacetate-CoA ligase  52.86 
 
 		 432 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>