81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1886 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1886  Methyltransferase type 11  100 
 
 
313 aa  645    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000470548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2572  hypothetical protein  55.91 
 
 
313 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.134075  normal  0.851171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0900  hypothetical protein  56.55 
 
 
313 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1245  methyltransferase type 11  44.44 
 
 
322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0125  hypothetical protein  43.45 
 
 
339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2700  hypothetical protein  41.27 
 
 
312 aa  249  5e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000485808  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6244  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 
326 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.099736  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1543  hypothetical protein  31.58 
 
 
709 aa  89.4  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0386  hypothetical protein  26.14 
 
 
716 aa  87.4  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172977  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2978  protein of unknown function DUF323  29.55 
 
 
553 aa  85.9  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4465  hypothetical protein  30.99 
 
 
699 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3577  protein of unknown function DUF323  32.52 
 
 
727 aa  84.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296354  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0265  hypothetical protein  29.11 
 
 
699 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228556 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0271  protein of unknown function DUF323  28.75 
 
 
704 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0053  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
701 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000456443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0275  hypothetical protein  28.75 
 
 
704 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3757  hypothetical protein  28.64 
 
 
699 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.62382  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0264  hypothetical protein  28.64 
 
 
699 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0275  hypothetical protein  28.33 
 
 
704 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0267  hypothetical protein  28.33 
 
 
704 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0381  hypothetical protein  27.08 
 
 
705 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0055  protein of unknown function DUF323  32.9 
 
 
701 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0017  hypothetical protein  30.67 
 
 
702 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0477  hypothetical protein  25.1 
 
 
701 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1078  protein of unknown function DUF323  25.61 
 
 
700 aa  80.5  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0361  methyltransferase type 12  28.97 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3422  hypothetical protein  27.27 
 
 
709 aa  77  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2910  methyltransferase type 11  29.95 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2257  hypothetical protein  26.14 
 
 
726 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44876  predicted protein  29.86 
 
 
933 aa  76.3  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3663  hypothetical protein  26.15 
 
 
722 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.793757  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0240  hypothetical protein  30 
 
 
702 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0416  protein of unknown function DUF323  30 
 
 
702 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.592351  hitchhiker  0.000236625 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0605  hypothetical protein  22 
 
 
747 aa  60.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1749  protein of unknown function DUF323  25.64 
 
 
696 aa  59.3  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  27.84 
 
 
255 aa  57  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0498  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 
281 aa  55.8  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136717  hitchhiker  0.000028196 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 
234 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 
235 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 
235 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 
234 aa  53.1  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2867  Methyltransferase type 11  23.01 
 
 
355 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.09 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2592  hypothetical protein  22.42 
 
 
703 aa  49.3  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.249838 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2220  Methyltransferase type 11  23.36 
 
 
314 aa  49.3  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 
264 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1747  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
280 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.044533  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
241 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1369  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
370 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  24.88 
 
 
339 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1366  methyltransferase type 11  23.11 
 
 
288 aa  47.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33230  predicted protein  27.06 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0061924  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1284  hypothetical protein  42.11 
 
 
60 aa  47.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.74 
 
 
273 aa  47  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  27.11 
 
 
354 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2320  hypothetical protein  43.86 
 
 
58 aa  47  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
280 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  24.14 
 
 
255 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 
270 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0063  hypothetical protein  40 
 
 
59 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000183566  hitchhiker  0.000563902 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0049  protein of unknown function DUF343  36.07 
 
 
64 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.625626  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  28.45 
 
 
243 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  28.45 
 
 
243 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0864  hypothetical protein  36.84 
 
 
62 aa  43.9  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2038  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.47 
 
 
233 aa  43.9  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  28.45 
 
 
243 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  27.27 
 
 
268 aa  44.3  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  27.12 
 
 
249 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  25.42 
 
 
265 aa  43.9  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  29.84 
 
 
261 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  52.27 
 
 
236 aa  43.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0006  hypothetical protein  34.92 
 
 
61 aa  43.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  28.45 
 
 
273 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  27.59 
 
 
243 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  27.56 
 
 
236 aa  43.5  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 
285 aa  43.1  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  27.73 
 
 
272 aa  42.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 
273 aa  42.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  25.83 
 
 
225 aa  42.4  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>