More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1877 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  100 
 
 
273 aa  567  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  49.46 
 
 
285 aa  259  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1837  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  45.38 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.396478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  44.94 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1350  peptidase M23B  43.14 
 
 
240 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000125735  hitchhiker  0.000000000113309 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  40.94 
 
 
241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  39.11 
 
 
247 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1843  Peptidase M23  56.14 
 
 
186 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000204635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  55.26 
 
 
186 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  54.05 
 
 
367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  48.82 
 
 
238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  48.82 
 
 
238 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3645  peptidase M23B  58.18 
 
 
184 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3012  peptidase M23B  56.64 
 
 
199 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000904375  normal  0.921697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0499  M23/M37 peptidase domain-containing protein  46.98 
 
 
251 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  50.83 
 
 
301 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  47.2 
 
 
223 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  47.24 
 
 
243 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  37.38 
 
 
282 aa  122  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  50.83 
 
 
319 aa  122  7e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  41.62 
 
 
274 aa  122  9e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1559  peptidase M23B  45.86 
 
 
192 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  50.83 
 
 
369 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  50 
 
 
313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  48.76 
 
 
318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  38.74 
 
 
468 aa  119  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0400  peptidase M23B  55.36 
 
 
198 aa  118  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000116464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.65 
 
 
321 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  40.96 
 
 
310 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  51.33 
 
 
452 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  42.55 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  49.12 
 
 
323 aa  116  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  50.44 
 
 
315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  46.61 
 
 
274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  40.52 
 
 
445 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  42.36 
 
 
524 aa  115  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  43.66 
 
 
238 aa  115  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  45.69 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  48 
 
 
824 aa  114  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  46.1 
 
 
430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  48.7 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  47.2 
 
 
316 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  43.62 
 
 
541 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  44.19 
 
 
446 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  37.84 
 
 
334 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  47.66 
 
 
465 aa  112  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  43.9 
 
 
411 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  45.99 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  41.1 
 
 
399 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  41.1 
 
 
399 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  44.44 
 
 
363 aa  110  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  45.95 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  46.15 
 
 
374 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  40.58 
 
 
462 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  42.14 
 
 
372 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  47.32 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  48.6 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  45.05 
 
 
292 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  45.95 
 
 
291 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  41.72 
 
 
419 aa  109  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  37.01 
 
 
249 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  50.44 
 
 
379 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  42.14 
 
 
358 aa  109  6e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  44.83 
 
 
323 aa  108  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  47.29 
 
 
523 aa  108  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  39.57 
 
 
300 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  41.78 
 
 
388 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  49.02 
 
 
457 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  47.27 
 
 
299 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  39.16 
 
 
247 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  38.89 
 
 
386 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  39.58 
 
 
386 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  47.71 
 
 
446 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  47.2 
 
 
590 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  49.09 
 
 
605 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  46.22 
 
 
309 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  42.5 
 
 
527 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3764  peptidase M23B  49.14 
 
 
194 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000390707  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  42.06 
 
 
324 aa  107  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  43.48 
 
 
305 aa  106  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  45.37 
 
 
460 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  49.59 
 
 
265 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  43.61 
 
 
442 aa  106  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  44.95 
 
 
454 aa  106  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  46.79 
 
 
447 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  46.79 
 
 
447 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02890  putative peptidase  38.3 
 
 
320 aa  106  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.648813  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  44.95 
 
 
454 aa  106  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  49.56 
 
 
349 aa  106  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  44.92 
 
 
417 aa  106  5e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  43.86 
 
 
373 aa  106  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  46.55 
 
 
271 aa  105  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  35.06 
 
 
404 aa  105  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  44.72 
 
 
298 aa  105  6e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  49.04 
 
 
293 aa  105  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  37.75 
 
 
308 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  43.64 
 
 
464 aa  105  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  38.89 
 
 
386 aa  105  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  47.2 
 
 
751 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  46.15 
 
 
376 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>