More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1860 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
382 aa  776    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  73.64 
 
 
378 aa  568  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  70.68 
 
 
379 aa  569  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  70.94 
 
 
379 aa  552  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  71.47 
 
 
379 aa  546  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  58.38 
 
 
379 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  57.07 
 
 
380 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  55.5 
 
 
379 aa  441  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  62.01 
 
 
379 aa  441  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  56.28 
 
 
379 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  54.71 
 
 
380 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  57.58 
 
 
380 aa  418  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  52.27 
 
 
379 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  49.47 
 
 
385 aa  363  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  49.6 
 
 
393 aa  362  8e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  48.18 
 
 
381 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  48.04 
 
 
383 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4797  extracellular ligand-binding receptor  48.18 
 
 
381 aa  354  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.863571  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  48.5 
 
 
399 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  46.37 
 
 
381 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  47.75 
 
 
396 aa  326  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  45.35 
 
 
392 aa  318  7.999999999999999e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  42.93 
 
 
393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  39.95 
 
 
394 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  40.95 
 
 
394 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  42.33 
 
 
389 aa  291  9e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0378  extracellular ligand-binding receptor  42.31 
 
 
396 aa  290  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1404  Extracellular ligand-binding receptor  39.69 
 
 
383 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1478  Extracellular ligand-binding receptor  36.97 
 
 
405 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  35.85 
 
 
381 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0080  extracellular ligand-binding receptor  37.92 
 
 
385 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217295  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2411  extracellular ligand-binding receptor  36.78 
 
 
381 aa  221  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3271  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.14 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0090  extracellular ligand-binding receptor  37.4 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2966  extracellular ligand-binding receptor  37.4 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106673  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0106  extracellular ligand-binding receptor  37.4 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0089  extracellular ligand-binding receptor  37.4 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332723  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2943  Extracellular ligand-binding receptor  35.52 
 
 
382 aa  219  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1230  Extracellular ligand-binding receptor  37.29 
 
 
382 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.520921  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0572  extracellular ligand-binding receptor  36.86 
 
 
383 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199084  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3364  extracellular ligand-binding receptor  35.71 
 
 
383 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.03 
 
 
388 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3329  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  35.14 
 
 
382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279448  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3199  Extracellular ligand-binding receptor  35.81 
 
 
382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3910  Extracellular ligand-binding receptor  36.03 
 
 
388 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868538  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3525  Extracellular ligand-binding receptor  36.36 
 
 
382 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2401  extracellular ligand-binding receptor  35.19 
 
 
385 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.682902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3043  extracellular ligand-binding receptor  35.23 
 
 
386 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.865554  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3513  extracellular ligand-binding receptor  35.62 
 
 
382 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0776121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0089  extracellular ligand-binding receptor  36.54 
 
 
385 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4096  extracellular ligand-binding receptor  35.79 
 
 
379 aa  209  6e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3324  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.13 
 
 
385 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2940  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.62 
 
 
385 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1603  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.62 
 
 
385 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3371  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.62 
 
 
473 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2999  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.62 
 
 
473 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1517  Extracellular ligand-binding receptor  34.43 
 
 
382 aa  206  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4097  extracellular ligand-binding receptor  34.95 
 
 
379 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0194  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.36 
 
 
473 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.63329  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3909  Extracellular ligand-binding receptor  35.7 
 
 
386 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4060  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.36 
 
 
473 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377113  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3986  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.36 
 
 
473 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1328  Extracellular ligand-binding receptor  32.44 
 
 
397 aa  203  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.125298  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2316  Extracellular ligand-binding receptor  32.91 
 
 
397 aa  203  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0524  extracellular ligand-binding receptor  33.79 
 
 
382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0024  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.91 
 
 
386 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471864  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5327  Extracellular ligand-binding receptor  35.07 
 
 
385 aa  195  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0968635  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3951  extracellular ligand-binding receptor  35.12 
 
 
385 aa  193  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.757866  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0483  Extracellular ligand-binding receptor  33.07 
 
 
411 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0914571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0197  extracellular ligand-binding receptor  35.09 
 
 
397 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4234  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.24 
 
 
410 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.408833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2820  extracellular ligand-binding receptor  30.15 
 
 
389 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2494  Extracellular ligand-binding receptor  31.03 
 
 
379 aa  182  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2700  extracellular ligand-binding receptor  31.52 
 
 
390 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322471  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1822  extracellular ligand-binding receptor  30.55 
 
 
381 aa  180  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.56038  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2232  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  31.15 
 
 
389 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2692  putative amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.63 
 
 
389 aa  176  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.407877  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1003  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.52 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437001  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0779  extracellular ligand-binding receptor  30.91 
 
 
383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0441144  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3241  extracellular ligand-binding receptor  31.79 
 
 
381 aa  173  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000702514  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0904  extracellular ligand-binding receptor  30.87 
 
 
377 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00289706  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0158  Extracellular ligand-binding receptor  30.49 
 
 
387 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0165  Extracellular ligand-binding receptor  30.79 
 
 
387 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4630  extracellular ligand-binding receptor  30.65 
 
 
383 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.511173  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2428  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.64 
 
 
389 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6271  putative amino-acid ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.64 
 
 
381 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1501  Extracellular ligand-binding receptor  29.56 
 
 
381 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.225006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3892  extracellular ligand-binding receptor  29.68 
 
 
381 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0900  extracellular ligand-binding receptor  29.13 
 
 
379 aa  158  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  9.53304e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  32.28 
 
 
373 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1500  Extracellular ligand-binding receptor  29.23 
 
 
388 aa  154  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.145866  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0968  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  29.86 
 
 
389 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0515  Extracellular ligand-binding receptor  29.12 
 
 
377 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.815299  normal  0.447794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0502  Extracellular ligand-binding receptor  28.77 
 
 
377 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3666  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.59 
 
 
389 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.279436  normal  0.958773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3257  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  29.23 
 
 
384 aa  145  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  31.75 
 
 
382 aa  144  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1504  Extracellular ligand-binding receptor  26.97 
 
 
387 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1164  Extracellular ligand-binding receptor  30.47 
 
 
404 aa  142  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0991  extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 
380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>