72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1859 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1859  amino acid-binding ACT domain protein  100 
 
 
143 aa  287  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00254903  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1670  amino acid-binding ACT domain-containing protein  84.62 
 
 
143 aa  247  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1736  ACT domain-containing protein  83.22 
 
 
143 aa  244  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567956  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1824  ACT domain-containing protein  82.52 
 
 
143 aa  241  2e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2132  amino acid-binding ACT domain-containing protein  84.62 
 
 
143 aa  241  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0184772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2036  amino acid-binding ACT domain protein  79.72 
 
 
143 aa  234  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14069e-13 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2191  amino acid-binding ACT domain protein  79.02 
 
 
143 aa  233  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1522  amino acid-binding ACT domain-containing protein  69.01 
 
 
170 aa  202  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0251264 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0447  amino acid-binding ACT domain protein  69.5 
 
 
143 aa  202  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.266025 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1138  amino acid-binding ACT domain protein  67.83 
 
 
143 aa  201  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000787959  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1682  amino acid-binding ACT domain-containing protein  67.13 
 
 
143 aa  198  2e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2088  ACT domain-containing protein  66.9 
 
 
143 aa  198  2e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0796  amino acid-binding ACT domain protein  65.73 
 
 
143 aa  192  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1120  amino acid-binding ACT domain protein  64.29 
 
 
143 aa  189  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.298875  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2322  amino acid-binding ACT domain-containing protein  60.14 
 
 
143 aa  186  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1570  ACT domain-containing protein  64.34 
 
 
143 aa  184  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3510  amino acid-binding ACT domain protein  58.74 
 
 
143 aa  178  3e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0260882  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2883  amino acid-binding ACT domain-containing protein  58.04 
 
 
143 aa  175  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0514  ACT domain-containing protein  57.34 
 
 
143 aa  170  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0167  amino acid-binding ACT domain protein  52.45 
 
 
143 aa  162  1e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0816  amino acid-binding ACT  52.14 
 
 
142 aa  162  2e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.842739  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1575  amino acid-binding ACT domain-containing protein  55.97 
 
 
143 aa  161  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.114486  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1503  amino acid-binding ACT domain protein  53.85 
 
 
143 aa  160  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0616  ACT domain-containing protein  51.75 
 
 
143 aa  156  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0832  amino acid-binding ACT domain-containing protein  51.85 
 
 
147 aa  150  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.19299e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0670  amino acid-binding ACT domain protein  50.7 
 
 
143 aa  144  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0040  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.76 
 
 
147 aa  138  2e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0041  amino acid-binding ACT domain protein  44.76 
 
 
147 aa  135  3e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0261  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.17 
 
 
144 aa  134  3e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0053  amino acid-binding ACT domain protein  44.76 
 
 
147 aa  135  3e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0071  amino acid-binding ACT domain-containing protein  51.11 
 
 
145 aa  134  3e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0037  ACT domain-containing protein  44.06 
 
 
147 aa  133  6e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4321  ACT domain-containing protein  46.21 
 
 
149 aa  132  1e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0860  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.06 
 
 
141 aa  129  1e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0495792  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1743  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.06 
 
 
141 aa  129  1e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.237603 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0168  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.66 
 
 
141 aa  127  6e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1971  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.75 
 
 
142 aa  125  1e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.55 
 
 
141 aa  124  4e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3082  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.66 
 
 
143 aa  123  8e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0069  amino acid-binding ACT domain protein  44.14 
 
 
142 aa  123  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0065  hypothetical protein  41.26 
 
 
142 aa  122  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0074  amino acid-binding ACT domain protein  41.67 
 
 
142 aa  119  2e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2859  amino acid-binding ACT domain protein  42.03 
 
 
151 aa  116  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1421  hypothetical protein  41.84 
 
 
151 aa  115  2e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3086  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.11 
 
 
135 aa  115  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0210  acetolactate synthase small subunit  40.58 
 
 
145 aa  114  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.846842 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1579  amino acid-binding ACT domain protein  39.72 
 
 
142 aa  112  2e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.210637 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0708  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.36 
 
 
144 aa  109  1e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.464159  normal  0.126423 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0208  amino acid-binding (ACT) protein  43.61 
 
 
145 aa  108  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_885  ACT domain protein  38.71 
 
 
129 aa  105  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13420  ACT domain-containing protein  38.3 
 
 
142 aa  105  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0901  ACT domain-containing protein  38.71 
 
 
129 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1014  ACT domain-containing protein  38.71 
 
 
129 aa  105  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1623  amino acid-binding ACT  40.29 
 
 
144 aa  104  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06230  ACT domain-containing protein  34.75 
 
 
142 aa  103  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.58032  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2122  amino acid-binding ACT domain protein  41.35 
 
 
144 aa  98.2  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0748  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.62 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00491505  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0720  putative acetolactate synthase small regulatory subunit  32.09 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.726001 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1455  hypothetical protein  35.96 
 
 
144 aa  82  2e-15  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.323054 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0909  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.58 
 
 
153 aa  82.8  2e-15  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.394001  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1319  ACT domain-containing protein  34.03 
 
 
144 aa  82  2e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1584  amino acid-binding ACT domain protein  34.62 
 
 
144 aa  79.3  2e-14  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0505283 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2427  amino acid-binding ACT domain protein  33 
 
 
129 aa  72.4  2e-12  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1433  ACT domain-containing protein  33 
 
 
129 aa  71.6  4e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50436  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2514  amino acid-binding ACT domain protein  32 
 
 
129 aa  70.9  5e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583261  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2396  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37 
 
 
129 aa  67.4  7e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3113  amino acid-binding ACT domain protein  36.61 
 
 
137 aa  65.5  3e-10  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0326  hypothetical protein  29.29 
 
 
125 aa  50.8  6e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2879  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27 
 
 
128 aa  50.4  7e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555565 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0873  amino acid-binding ACT  23.91 
 
 
152 aa  48.1  4e-05  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1309  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.47 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2624  acetolactate synthase, small subunit  33.33 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>