More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1855 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1855  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  100 
 
 
223 aa  447  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000195986  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1895  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  27.94 
 
 
219 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000374045  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  27.61 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  26.83 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0737  ABC transporter related  27.54 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  25.93 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0496  ABC transporter related  25.15 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00107814  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  27.27 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3370  ABC transporter related  27.08 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  25 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2023  ABC transporter, ATP-binding protein  28.89 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0214049  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1835  ABC transporter, ATP-binding protein  28.89 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.131138  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1654  ABC transporter, ATP-binding protein  28.89 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0733  ABC transporter-related protein  26.35 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.329181 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  25.45 
 
 
275 aa  64.3  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  30.2 
 
 
298 aa  64.7  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4233  ABC transporter related  27.08 
 
 
271 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36582  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0713  ABC transporter related  26.38 
 
 
272 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516004 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  25.69 
 
 
265 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0872  hypothetical protein  25.69 
 
 
265 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0722  ABC transporter related  26.38 
 
 
277 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.165434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3609  ABC transporter related  27.03 
 
 
270 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0694  ABC transporter related  29.53 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0692  ABC transporter related  26.38 
 
 
277 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3662  ABC transporter related  26.38 
 
 
279 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392823  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  25.17 
 
 
262 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  25.68 
 
 
269 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  23.32 
 
 
266 aa  62.8  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  28.22 
 
 
273 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  28.22 
 
 
273 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  28.22 
 
 
273 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  28.22 
 
 
273 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  28.22 
 
 
273 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0678  ABC transporter related  27.08 
 
 
272 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0646516 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  28.22 
 
 
273 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  29.7 
 
 
237 aa  62.4  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  25.5 
 
 
270 aa  62.4  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0679  ABC transporter related  26.39 
 
 
272 aa  62  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.962432 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  26.79 
 
 
271 aa  62  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  28.05 
 
 
247 aa  61.6  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  25.31 
 
 
269 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0350  ABC transporter  25.83 
 
 
376 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100794  normal  0.782008 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1190  ATP-binding ABC transporter protein  28.83 
 
 
281 aa  61.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726252  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  26.35 
 
 
282 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3343  ABC transporter related  26.39 
 
 
272 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0165  heme exporter protein CcmA  32.45 
 
 
221 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3954  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  26.39 
 
 
272 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  25 
 
 
269 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  26.17 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  26.8 
 
 
276 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  26.63 
 
 
286 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  27.61 
 
 
273 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  24.55 
 
 
283 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  26.8 
 
 
274 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  25.31 
 
 
269 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1034  ABC transporter related  30.77 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  24.32 
 
 
269 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  24.07 
 
 
269 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2651  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  29.38 
 
 
243 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  26.39 
 
 
270 aa  60.1  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  24.44 
 
 
255 aa  60.1  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  24.07 
 
 
269 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2386  ABC transporter related  25.29 
 
 
229 aa  60.1  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  25 
 
 
270 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  26.05 
 
 
359 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5188  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  25.52 
 
 
343 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  24.1 
 
 
282 aa  58.9  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0448  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  25.15 
 
 
272 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.885469  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  24.69 
 
 
269 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  26.63 
 
 
286 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0721  ABC transporter related  26.39 
 
 
272 aa  59.3  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1146  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  25.15 
 
 
272 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0512  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  25.15 
 
 
272 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0925  ABC transporter, ATP-binding protein  28.49 
 
 
254 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0535  ABC transporter related  27.14 
 
 
271 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  28.38 
 
 
296 aa  58.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1923  cell division ATP-binding protein FtsE  28.48 
 
 
229 aa  58.5  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000106993  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  25 
 
 
269 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  26.99 
 
 
273 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  26.17 
 
 
293 aa  58.5  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  25.54 
 
 
246 aa  58.5  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0237  ABC transporter related  24.66 
 
 
268 aa  58.5  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  26.22 
 
 
267 aa  58.2  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  26.38 
 
 
273 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2120  ABC transporter related  28.66 
 
 
274 aa  58.2  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  28.97 
 
 
279 aa  58.5  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  28.72 
 
 
233 aa  58.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0236  ABC transporter-like  26.17 
 
 
374 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127209  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  27.61 
 
 
273 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  28.85 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  31.37 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  27.44 
 
 
278 aa  58.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  24.04 
 
 
333 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  26.38 
 
 
272 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0732  cell division ATP-binding protein FtsE  25.9 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  25.68 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  25.97 
 
 
240 aa  57  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002409  ABC transporter ATP-binding protein  26.35 
 
 
267 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  25 
 
 
397 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  25.68 
 
 
272 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>