More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1833 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 321 aa  658    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  52.35 
 
 		 316 aa  330  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  51 
 
 		 333 aa  316  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  50.34 
 
 		 304 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  50 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  50.46 
 
 		 326 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  48.99 
 
 		 304 aa  298  7e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  34.58 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  33.86 
 
 		 316 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  34.18 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  33.86 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  33.86 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  33.86 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  33.54 
 
 		 316 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  39.1 
 
 		 309 aa  207  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  36.28 
 
 		 314 aa  203  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  33.44 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  33.75 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  33.87 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.6 
 
 		 349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  31.15 
 
 		 333 aa  189  5.999999999999999e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  31.55 
 
 		 316 aa  189  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.41 
 
 		 514 aa  188  9e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  31.53 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  32.1 
 
 		 323 aa  182  6e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  31.95 
 
 		 293 aa  179  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  40.14 
 
 		 312 aa  176  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  29.02 
 
 		 298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  31.89 
 
 		 307 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  28.39 
 
 		 298 aa  169  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  33.33 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  29.97 
 
 		 328 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  30 
 
 		 314 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  30.38 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  32.82 
 
 		 333 aa  159  6e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  34.17 
 
 		 506 aa  157  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  34.32 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  31.67 
 
 		 358 aa  155  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  30.7 
 
 		 332 aa  155  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.8 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  35.69 
 
 		 324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  36.08 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  34.06 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  27.3 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  27.3 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  32.29 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  28.8 
 
 		 322 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0438  periplasmic solute binding protein  27.25 
 
 		 336 aa  142  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.801015  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  31.76 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  31.93 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  28.08 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  29.75 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  31.94 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  29.34 
 
 		 307 aa  139  7e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  32.57 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  29.08 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  30.06 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  32.14 
 
 		 282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  29.75 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  30.39 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  30 
 
 		 321 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  28.96 
 
 		 339 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  29.51 
 
 		 296 aa  132  6e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  29.38 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  28.13 
 
 		 515 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  28.13 
 
 		 515 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  30.49 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  30.42 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  28.53 
 
 		 331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  31.34 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18230  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.32 
 
 		 365 aa  129  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  27.41 
 
 		 287 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  30.18 
 
 		 368 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  30.28 
 
 		 278 aa  129  8.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  33.98 
 
 		 346 aa  129  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  31.29 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2168  periplasmic solute binding protein  32.28 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0250158  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  32.26 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  28.1 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  28.1 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  30.6 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  30.94 
 
 		 292 aa  125  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  31.19 
 
 		 307 aa  125  7e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  29.68 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  29.57 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  33.07 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  28.78 
 
 		 323 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  32.22 
 
 		 300 aa  124  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  30.69 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11830  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.25 
 
 		 339 aa  123  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00348761  normal  0.825122 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  28.01 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 		 321 aa  122  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  30.9 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  28.08 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  29.6 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  31.99 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  30.99 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  30.03 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  30.98 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  34.51 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>