More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1810 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4574  sodium/hydrogen exchanger  54.09 
 
 		 764 aa  751    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520226 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 771 aa  1524    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  41.73 
 
 		 777 aa  523  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  35.54 
 
 		 586 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  35.94 
 
 		 586 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  35.54 
 
 		 586 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  35.34 
 
 		 586 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  36.75 
 
 		 585 aa  280  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  36.16 
 
 		 587 aa  278  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  32.76 
 
 		 585 aa  278  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  36.31 
 
 		 585 aa  278  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.94 
 
 		 587 aa  276  9e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  28.1 
 
 		 741 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.53 
 
 		 587 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 		 757 aa  271  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  33.27 
 
 		 585 aa  271  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  37.1 
 
 		 585 aa  270  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  25.29 
 
 		 741 aa  254  5.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  26.75 
 
 		 747 aa  254  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  32.28 
 
 		 586 aa  251  5e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  26.76 
 
 		 745 aa  249  9e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 710 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  25.55 
 
 		 782 aa  205  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  31.48 
 
 		 762 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  29.26 
 
 		 674 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  29.35 
 
 		 673 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  31.68 
 
 		 684 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  30.21 
 
 		 773 aa  150  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  26.57 
 
 		 666 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  29.89 
 
 		 741 aa  148  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  30.31 
 
 		 671 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  30.67 
 
 		 667 aa  147  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  28.95 
 
 		 567 aa  147  9e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  30.52 
 
 		 636 aa  146  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  29.47 
 
 		 771 aa  146  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  28.95 
 
 		 567 aa  146  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  27.73 
 
 		 671 aa  146  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 775 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.22 
 
 		 567 aa  144  8e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  29.43 
 
 		 665 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  29.43 
 
 		 665 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0711  sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 		 581 aa  142  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3434  sodium/hydrogen exchanger  32.11 
 
 		 577 aa  142  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  31.02 
 
 		 682 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  30.59 
 
 		 664 aa  140  8.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  31.25 
 
 		 561 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 672 aa  139  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  27.37 
 
 		 666 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  30.02 
 
 		 674 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  27.62 
 
 		 573 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  30.15 
 
 		 652 aa  138  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  26.76 
 
 		 441 aa  138  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  28.21 
 
 		 648 aa  138  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  29.06 
 
 		 663 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  27.71 
 
 		 666 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  31.17 
 
 		 561 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  27.91 
 
 		 457 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  28.72 
 
 		 555 aa  137  8e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.5 
 
 		 588 aa  137  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  27.57 
 
 		 664 aa  137  9e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  28.46 
 
 		 648 aa  137  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  29.79 
 
 		 606 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  28.74 
 
 		 663 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  29.58 
 
 		 562 aa  135  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  28.98 
 
 		 562 aa  134  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  32.99 
 
 		 652 aa  134  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  28.96 
 
 		 654 aa  134  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  28.75 
 
 		 648 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  28.75 
 
 		 648 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  28.75 
 
 		 648 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.89 
 
 		 669 aa  134  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.89 
 
 		 669 aa  134  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  28.89 
 
 		 669 aa  134  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.89 
 
 		 669 aa  134  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.89 
 
 		 669 aa  134  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  28.05 
 
 		 606 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.97 
 
 		 697 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  30.15 
 
 		 678 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  28.46 
 
 		 648 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  28.46 
 
 		 648 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  28.89 
 
 		 669 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  28.92 
 
 		 566 aa  132  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1858  sodium/hydrogen exchanger  30.08 
 
 		 613 aa  131  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  29.7 
 
 		 668 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  29.59 
 
 		 649 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1156  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  27.42 
 
 		 595 aa  130  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.269314  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  27.47 
 
 		 648 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  25.86 
 
 		 665 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  28.5 
 
 		 670 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6319  putative potassium efflux transporter  30.81 
 
 		 568 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  27.3 
 
 		 658 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  29.81 
 
 		 665 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  29.01 
 
 		 648 aa  129  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1281  sodium/hydrogen exchanger  28.68 
 
 		 572 aa  129  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.330977  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0543  sodium/hydrogen exchanger  29.35 
 
 		 631 aa  128  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.015433 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  30.34 
 
 		 657 aa  128  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  29.59 
 
 		 650 aa  129  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  30.39 
 
 		 660 aa  128  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3033  putative cation:proton antiport protein  29.82 
 
 		 561 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119547  potassium:hydrogen antiporter, putative  25.84 
 
 		 671 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.2676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>