136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1804 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1804  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  533  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2632  hypothetical protein  71.26 
 
 
261 aa  374  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0680234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2290  hypothetical protein  72.41 
 
 
261 aa  358  5e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.47425e-05 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1073  hypothetical protein  64.89 
 
 
263 aa  345  6e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.780627  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2007  ABC-type transport system, permease component  59.39 
 
 
266 aa  315  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089276  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4760  hypothetical protein  39.92 
 
 
264 aa  209  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1139  hypothetical protein  37.4 
 
 
265 aa  206  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.529413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5079  hypothetical protein  37.98 
 
 
265 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5081  hypothetical protein  37.98 
 
 
265 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0161  hypothetical protein  37.69 
 
 
265 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5084  hypothetical protein  37.98 
 
 
265 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4673  hypothetical protein  37.6 
 
 
265 aa  202  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4653  hypothetical protein  37.31 
 
 
265 aa  202  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5050  hypothetical protein  37.31 
 
 
265 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4811  hypothetical protein  36.92 
 
 
265 aa  200  2e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5176  hypothetical protein  36.92 
 
 
265 aa  200  2e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0755  hypothetical protein  40.47 
 
 
262 aa  192  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  3.02353e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0731  hypothetical protein  40.47 
 
 
262 aa  192  6e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  2.07096e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4241  hypothetical protein  40.78 
 
 
258 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15630  conserved hypothetical protein TIGR00245  36.96 
 
 
260 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3518  hypothetical protein  40.55 
 
 
257 aa  189  3e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000832658  normal  0.16619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2510  hypothetical protein  39.84 
 
 
258 aa  189  3e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4303  hypothetical protein  39.61 
 
 
258 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.121514 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3461  hypothetical protein  37.3 
 
 
262 aa  184  9e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1727  hypothetical protein  37.7 
 
 
265 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0764  hypothetical protein  40.47 
 
 
269 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0571603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0900  hypothetical protein  38.34 
 
 
258 aa  175  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2456  hypothetical protein  38.27 
 
 
261 aa  174  1e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1171  hypothetical protein  42.62 
 
 
261 aa  173  2e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.739375  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0698  hypothetical protein  39.69 
 
 
269 aa  172  4e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.217447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2323  ABC transporter, inner membrane subunit  40.55 
 
 
268 aa  172  6e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0279  hypothetical protein  37.65 
 
 
260 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2266  hypothetical protein  40 
 
 
272 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336185  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1863  hypothetical protein  39.37 
 
 
268 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00500964  normal  0.0941942 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1069  hypothetical protein  39.92 
 
 
272 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.443958  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2190  hypothetical protein  39.92 
 
 
272 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2153  hypothetical protein  39.92 
 
 
272 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0097  hypothetical protein  39.92 
 
 
272 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1798  hypothetical protein  39.92 
 
 
272 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.539315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2321  hypothetical protein  39.92 
 
 
272 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1311  hypothetical protein  39.92 
 
 
272 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0986  hypothetical protein  39.1 
 
 
268 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1807  hypothetical protein  36.98 
 
 
265 aa  168  9e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162766  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0254  hypothetical protein  35.97 
 
 
251 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.59378e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1234  hypothetical protein  33.85 
 
 
261 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1835  hypothetical protein  41.49 
 
 
267 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1685  hypothetical protein  38.29 
 
 
267 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5072  putative ABC transporter, inner membrane subunit  40.08 
 
 
267 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362537  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2539  hypothetical protein  39.41 
 
 
266 aa  165  6e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0939059  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1713  hypothetical protein  38.15 
 
 
267 aa  164  2e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1309  hypothetical protein  33.59 
 
 
259 aa  163  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0169  ABC transporter, permease protein, putative  43.36 
 
 
263 aa  162  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.645871  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6305  hypothetical protein  39.62 
 
 
267 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1799  hypothetical protein  39.62 
 
 
267 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.551052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1774  hypothetical protein  39.62 
 
 
267 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.113625  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1218  hypothetical protein  36.19 
 
 
258 aa  161  9e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1087  hypothetical protein  32.5 
 
 
263 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1497  hypothetical protein  37.98 
 
 
267 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0286332 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0534  hypothetical protein  37.02 
 
 
267 aa  158  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1097  hypothetical protein  34.9 
 
 
257 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215237  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1348  hypothetical protein  34.05 
 
 
264 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1058  hypothetical protein  31.47 
 
 
261 aa  151  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0748  hypothetical protein  38.55 
 
 
272 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0767  hypothetical protein  36.84 
 
 
263 aa  145  8e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0076  hypothetical protein  35.66 
 
 
269 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0298659  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2410  hypothetical protein  39.22 
 
 
265 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0080  ABC transporter permease  30.95 
 
 
266 aa  144  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2239  hypothetical protein  36.36 
 
 
263 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255232  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7995  hypothetical protein  36.36 
 
 
263 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138428  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2020  hypothetical protein  41.23 
 
 
263 aa  141  1e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3633  hypothetical protein  36.64 
 
 
265 aa  140  2e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1437  hypothetical protein  37.85 
 
 
264 aa  140  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318799  normal  0.0549134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0072  hypothetical protein  40.91 
 
 
263 aa  139  4e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0689  hypothetical protein  31.89 
 
 
257 aa  139  5e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.393246  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1378  hypothetical protein  31.3 
 
 
242 aa  137  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0154277  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0198  hypothetical protein  36.75 
 
 
268 aa  135  7e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.68555 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1145  ABC transporter, inner membrane subunit  31.37 
 
 
265 aa  135  9e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  4.31161e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2942  hypothetical protein  32.41 
 
 
256 aa  134  1e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0175  hypothetical protein  38.78 
 
 
241 aa  135  1e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3829  putative ABC transport system permease protein  35.81 
 
 
263 aa  134  2e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  3.96404e-07 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0826  membrane protein  37.67 
 
 
263 aa  133  2e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.293934  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3122  hypothetical protein  36.36 
 
 
268 aa  133  4e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.859294  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003828  ABC-type uncharacterized transport system permease component  37.61 
 
 
270 aa  131  1e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0121  hypothetical protein  40.31 
 
 
266 aa  130  2e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0165  hypothetical protein  38.74 
 
 
266 aa  130  2e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.980165  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4093  hypothetical protein  36.13 
 
 
238 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01854  hypothetical protein  33.6 
 
 
266 aa  129  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2859  hypothetical protein  33.2 
 
 
252 aa  128  8e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4666  hypothetical protein  28.98 
 
 
257 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0214  hypothetical protein  33.98 
 
 
263 aa  125  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.458812  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0731  hypothetical protein  37.12 
 
 
271 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00447  hypothetical protein  29.67 
 
 
259 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0570  hypothetical protein  29.67 
 
 
259 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0540  hypothetical protein  29.67 
 
 
259 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00442  predicted inner membrane protein  29.67 
 
 
259 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0595  hypothetical protein  29.67 
 
 
259 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3125  hypothetical protein  29.67 
 
 
259 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101868 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3119  conserved hypothetical protein  29.67 
 
 
259 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0530  hypothetical protein  29.27 
 
 
259 aa  122  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0700  hypothetical protein  36.21 
 
 
264 aa  121  1e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>