28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1793 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1793  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000475363  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0357  hypothetical protein  64.5 
 
 
234 aa  326  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000646753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0377  hypothetical protein  63.64 
 
 
234 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2332  hypothetical protein  59.57 
 
 
245 aa  300  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  48.93 
 
 
252 aa  255  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1485  hypothetical protein  46.35 
 
 
234 aa  238  6.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520074  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  48.92 
 
 
231 aa  238  8e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1486  hypothetical protein  45.45 
 
 
234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  45.45 
 
 
236 aa  224  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  43.29 
 
 
238 aa  214  7e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2837  hypothetical protein  46.81 
 
 
236 aa  214  8e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000106697  hitchhiker  2.88656e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  43.1 
 
 
238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2646  hypothetical protein  42.86 
 
 
229 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  26.11 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  26.6 
 
 
273 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  23 
 
 
271 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  25.93 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  23 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  24.88 
 
 
273 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  20.21 
 
 
214 aa  58.9  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  22.89 
 
 
275 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  23.53 
 
 
273 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  23.56 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  25.41 
 
 
271 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0168  putative hypoxanthine phosphoribosyl transferase with additional GAF motif  23.2 
 
 
310 aa  45.8  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4490  transport-associated  23.5 
 
 
278 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  21.83 
 
 
202 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  20.79 
 
 
204 aa  42.4  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>