More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1755 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
265 aa  534  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  55.47 
 
 
265 aa  300  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  50.57 
 
 
265 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.67 
 
 
265 aa  257  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  46.9 
 
 
265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  49.24 
 
 
267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  48.86 
 
 
266 aa  238  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  35.07 
 
 
272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.48 
 
 
810 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.48 
 
 
878 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  35.75 
 
 
725 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  31.94 
 
 
875 aa  112  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.34 
 
 
632 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 
362 aa  108  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  33.18 
 
 
1676 aa  108  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 
681 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  32.11 
 
 
816 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 
685 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 
3172 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  33.68 
 
 
865 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 
4079 aa  102  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 
465 aa  102  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  31.74 
 
 
3301 aa  102  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 
909 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 
543 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  31.96 
 
 
603 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  29.13 
 
 
576 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 
1276 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  33.7 
 
 
560 aa  99.4  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  34.74 
 
 
764 aa  99.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 
927 aa  98.6  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 
620 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  34.18 
 
 
1694 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
3035 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  35.64 
 
 
714 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 
4489 aa  96.7  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.58 
 
 
626 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.04 
 
 
620 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
614 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.02 
 
 
836 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.58 
 
 
614 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  31.51 
 
 
837 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.58 
 
 
614 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 
3560 aa  96.3  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.58 
 
 
626 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
614 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  29.52 
 
 
622 aa  95.5  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
614 aa  95.5  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  34.09 
 
 
594 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.35 
 
 
586 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 
612 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
615 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.41 
 
 
730 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 
637 aa  92  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  32 
 
 
417 aa  92  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  32.75 
 
 
583 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  31.38 
 
 
573 aa  92  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  29.32 
 
 
681 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 
639 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  29.72 
 
 
795 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.08 
 
 
707 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  30.04 
 
 
936 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
602 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 
739 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.07 
 
 
626 aa  90.1  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  31.22 
 
 
887 aa  90.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  29.67 
 
 
733 aa  89.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  33.51 
 
 
714 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
1737 aa  89.4  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.41 
 
 
397 aa  89.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 
3145 aa  89.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  33.15 
 
 
462 aa  89.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  30.99 
 
 
1013 aa  88.6  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 
323 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 
1486 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 
612 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  28.51 
 
 
635 aa  87  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 
448 aa  87  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 
1121 aa  86.7  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.02 
 
 
639 aa  86.3  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 
602 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
750 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
601 aa  86.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 
847 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 
409 aa  85.5  9e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  30.77 
 
 
706 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 
634 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
689 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.59 
 
 
2240 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
592 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  34.01 
 
 
623 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 
637 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  27.9 
 
 
435 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 
374 aa  84  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 
466 aa  84.3  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 
409 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  30.4 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.21 
 
 
1007 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.53 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>