More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1754 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1946  acetate kinase  80.48 
 
 
421 aa  726    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  82.62 
 
 
421 aa  738    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  70.71 
 
 
421 aa  642    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  80.76 
 
 
421 aa  728    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2277  acetate kinase  80.71 
 
 
421 aa  727    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000044561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  80.95 
 
 
421 aa  731    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0608  acetate kinase  74.58 
 
 
421 aa  687    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  75.06 
 
 
417 aa  682    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  100 
 
 
421 aa  870    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000122438  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0557  acetate kinase  67.7 
 
 
420 aa  615  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0394  acetate kinase  61.45 
 
 
419 aa  555  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3448  acetate kinase  58.1 
 
 
403 aa  501  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0328  acetate kinase  57.14 
 
 
409 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000406693 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0348  acetate kinase  56.64 
 
 
409 aa  482  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0149  acetate kinase  55.36 
 
 
404 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0720  acetate kinase  54.55 
 
 
452 aa  482  1e-135  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0988409  hitchhiker  0.0000000373865 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  55.39 
 
 
398 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  53.13 
 
 
398 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  54.14 
 
 
405 aa  448  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  53.25 
 
 
403 aa  437  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  53.25 
 
 
403 aa  437  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  50.5 
 
 
399 aa  429  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  54.09 
 
 
401 aa  429  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  52.38 
 
 
397 aa  427  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  52.19 
 
 
399 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  51.87 
 
 
408 aa  424  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  50.25 
 
 
396 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  49.64 
 
 
406 aa  422  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  50.5 
 
 
397 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  49.75 
 
 
397 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  50 
 
 
397 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  50 
 
 
397 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  49.75 
 
 
397 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  50 
 
 
397 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  50.51 
 
 
397 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  50.25 
 
 
397 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  49.75 
 
 
397 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  49.75 
 
 
397 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  49.49 
 
 
397 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  50.76 
 
 
397 aa  415  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  49.75 
 
 
397 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  48.37 
 
 
397 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  51.12 
 
 
406 aa  412  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  50.62 
 
 
401 aa  410  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  50.13 
 
 
395 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  48.37 
 
 
397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  48.75 
 
 
404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  49.25 
 
 
397 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  50.25 
 
 
401 aa  402  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  48.25 
 
 
399 aa  402  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  50.25 
 
 
398 aa  403  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  48.49 
 
 
396 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  49.37 
 
 
400 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  49.37 
 
 
400 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  47.12 
 
 
398 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  47.75 
 
 
398 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  47.5 
 
 
398 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  47.87 
 
 
396 aa  391  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  48.51 
 
 
402 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  47.34 
 
 
417 aa  387  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  47.25 
 
 
397 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000914313  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  47 
 
 
398 aa  383  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  47.65 
 
 
402 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  47.12 
 
 
398 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  49.12 
 
 
380 aa  378  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  47.67 
 
 
402 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  45.36 
 
 
401 aa  377  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0641  acetate kinase  42.89 
 
 
405 aa  372  1e-102  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00773095  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  45.86 
 
 
397 aa  369  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  45.62 
 
 
422 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  47.46 
 
 
398 aa  363  3e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  46.42 
 
 
404 aa  363  3e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  46.87 
 
 
400 aa  363  3e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  46.73 
 
 
399 aa  362  6e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  46.73 
 
 
399 aa  362  6e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  46.48 
 
 
399 aa  361  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  45.3 
 
 
402 aa  359  5e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  46.37 
 
 
399 aa  358  8e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  46.67 
 
 
396 aa  358  8e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  46.37 
 
 
399 aa  358  8e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  46.37 
 
 
399 aa  358  8e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  45.84 
 
 
397 aa  358  8e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  46.37 
 
 
399 aa  358  8e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  48.06 
 
 
394 aa  358  9e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  46.23 
 
 
399 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  44.36 
 
 
394 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  45.02 
 
 
399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  46.41 
 
 
396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  45.25 
 
 
404 aa  356  2.9999999999999997e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1280  acetate kinase  44.39 
 
 
418 aa  356  5e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  43.25 
 
 
399 aa  356  5e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0920  acetate kinase  44.28 
 
 
414 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  47.24 
 
 
398 aa  354  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1834  acetate kinase  47.46 
 
 
397 aa  353  2e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000432075  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1180  acetate kinase  44.78 
 
 
414 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  45.13 
 
 
396 aa  352  8.999999999999999e-96  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  44.62 
 
 
398 aa  352  1e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  43.86 
 
 
406 aa  350  3e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0296  acetate kinase  44.94 
 
 
403 aa  347  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2295  acetate kinase  44.33 
 
 
395 aa  347  2e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>