More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1744 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1744  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 376 aa  776    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000105238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.72 
 
 		 953 aa  256  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.12 
 
 		 1260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.84 
 
 		 557 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.1 
 
 		 692 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.44 
 
 		 1132 aa  250  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2264  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.36 
 
 		 692 aa  250  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.52 
 
 		 1260 aa  250  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.01 
 
 		 663 aa  249  7e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.39 
 
 		 639 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1443  sensor histidine kinase/response regulator  53.19 
 
 		 654 aa  247  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.92 
 
 		 711 aa  247  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.61 
 
 		 677 aa  242  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 		 796 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.21 
 
 		 664 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.6 
 
 		 1279 aa  240  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.3 
 
 		 673 aa  239  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 		 796 aa  239  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  50.41 
 
 		 824 aa  238  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.36 
 
 		 1322 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  51.45 
 
 		 844 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.79 
 
 		 857 aa  238  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.59 
 
 		 656 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3045  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.19 
 
 		 954 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00011876  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  50.62 
 
 		 749 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.19 
 
 		 828 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.17 
 
 		 769 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.55 
 
 		 1076 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  47.93 
 
 		 1112 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  46 
 
 		 753 aa  232  9e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.79 
 
 		 853 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.04 
 
 		 817 aa  232  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.79 
 
 		 859 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 		 1047 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.43 
 
 		 819 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.1 
 
 		 962 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.74 
 
 		 793 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1296  sensory box histidine kinase/response regulator  47.48 
 
 		 726 aa  230  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00691779  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.41 
 
 		 503 aa  230  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.534636  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  50 
 
 		 654 aa  229  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.64 
 
 		 1176 aa  229  6e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  47.28 
 
 		 892 aa  229  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0542  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.95 
 
 		 1050 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.757487  normal  0.763027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  44.75 
 
 		 646 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.84 
 
 		 650 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4271  histidine kinase  46.18 
 
 		 525 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.76 
 
 		 1105 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1700  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.8 
 
 		 850 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.99866 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.42 
 
 		 752 aa  227  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000882027 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.76 
 
 		 822 aa  226  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.95 
 
 		 689 aa  226  6e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0334119  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  46.96 
 
 		 646 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2474  histidine kinase  33.97 
 
 		 559 aa  226  7e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.369133 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1847  histidine kinase  47.76 
 
 		 785 aa  225  8e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.15 
 
 		 926 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  49.39 
 
 		 733 aa  225  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.42 
 
 		 1113 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.8 
 
 		 1047 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.34 
 
 		 845 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.36 
 
 		 823 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1983  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.5 
 
 		 847 aa  223  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.138459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.67 
 
 		 1053 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.47 
 
 		 1180 aa  224  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.69 
 
 		 766 aa  223  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.91 
 
 		 645 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.69 
 
 		 773 aa  223  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.97 
 
 		 853 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.48 
 
 		 849 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1644  histidine kinase  43.21 
 
 		 779 aa  223  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000228151 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  45.56 
 
 		 527 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1866  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.1 
 
 		 649 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0515  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.13 
 
 		 689 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.88 
 
 		 926 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  46.03 
 
 		 529 aa  222  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.03 
 
 		 1079 aa  222  7e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.7 
 
 		 1108 aa  222  9e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.95 
 
 		 874 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6265  sensor histidine kinase  46.03 
 
 		 490 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0824359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.16 
 
 		 880 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.13 
 
 		 845 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.75 
 
 		 766 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.01 
 
 		 1018 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0209449 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  46.31 
 
 		 936 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.86 
 
 		 522 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7127  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.69 
 
 		 782 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.612446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.91 
 
 		 983 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0595  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 680 aa  221  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2023  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.12 
 
 		 1021 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168563  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4378  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  47.7 
 
 		 627 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.055155  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.32 
 
 		 936 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4355  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  47.7 
 
 		 638 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.93 
 
 		 999 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.04 
 
 		 643 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4222  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  47.28 
 
 		 627 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288914  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0366  GAF sensor hybrid histidine kinase  44.19 
 
 		 618 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.41 
 
 		 1102 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1968  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  47.13 
 
 		 933 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.33 
 
 		 1115 aa  219  5e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  46.18 
 
 		 866 aa  219  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.35 
 
 		 803 aa  219  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>