More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1648 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  78.65 
 
 		 531 aa  877    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  67.67 
 
 		 532 aa  753    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  76.82 
 
 		 533 aa  857    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  78.28 
 
 		 531 aa  865    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  62.5 
 
 		 541 aa  678    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  78.46 
 
 		 531 aa  873    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  77.2 
 
 		 533 aa  862    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  100 
 
 		 534 aa  1110    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  79.78 
 
 		 531 aa  890    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1082  L-aspartate oxidase  58.65 
 
 		 542 aa  628  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  58.65 
 
 		 534 aa  626  1e-178  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  58.44 
 
 		 535 aa  621  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  58.06 
 
 		 535 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4514  L-aspartate oxidase  61.49 
 
 		 527 aa  616  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  58.06 
 
 		 535 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2252  L-aspartate oxidase  56.78 
 
 		 555 aa  610  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000133883  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  56.47 
 
 		 538 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54450  L-aspartate oxidase  56.47 
 
 		 538 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883474  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  56.61 
 
 		 534 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1472  L-aspartate oxidase  56.77 
 
 		 533 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  56.93 
 
 		 525 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  56.74 
 
 		 536 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  57.66 
 
 		 537 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  56.61 
 
 		 534 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  58.44 
 
 		 534 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  58.82 
 
 		 535 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2936  L-aspartate oxidase  57.01 
 
 		 538 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  57.52 
 
 		 532 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  57.14 
 
 		 536 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  56.37 
 
 		 535 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  57.85 
 
 		 537 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  57.85 
 
 		 537 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1271  L-aspartate oxidase  57.85 
 
 		 537 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  57.85 
 
 		 537 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  55.47 
 
 		 579 aa  599  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  55.79 
 
 		 539 aa  601  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  57.47 
 
 		 537 aa  596  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  55.94 
 
 		 538 aa  596  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  56.07 
 
 		 534 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  56.9 
 
 		 537 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  57.09 
 
 		 537 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  55.72 
 
 		 550 aa  597  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  55.32 
 
 		 543 aa  595  1e-169  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  56.32 
 
 		 538 aa  594  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  56.32 
 
 		 536 aa  594  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  53.46 
 
 		 533 aa  592  1e-168  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4092  L-aspartate oxidase  57.36 
 
 		 523 aa  592  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.757551  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  56.16 
 
 		 537 aa  594  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  56.81 
 
 		 537 aa  594  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  53.93 
 
 		 538 aa  592  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  56.7 
 
 		 537 aa  593  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  55.32 
 
 		 531 aa  590  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  55.09 
 
 		 539 aa  588  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  55.36 
 
 		 538 aa  588  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  55.64 
 
 		 538 aa  590  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  55.64 
 
 		 538 aa  590  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1466  L-aspartate oxidase  54.87 
 
 		 543 aa  588  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00248368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  55.17 
 
 		 534 aa  590  1e-167  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1128  L-aspartate oxidase  55.94 
 
 		 533 aa  589  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1181  L-aspartate oxidase  55.94 
 
 		 545 aa  589  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.217249  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0873  L-aspartate oxidase  56.38 
 
 		 535 aa  591  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3603  L-aspartate oxidase  55.94 
 
 		 533 aa  589  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0843929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1957  L-aspartate oxidase  57.47 
 
 		 546 aa  585  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.422592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  57.14 
 
 		 533 aa  586  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2264  L-aspartate oxidase  54.27 
 
 		 542 aa  586  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295473  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  56.03 
 
 		 541 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  55.62 
 
 		 539 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  55.32 
 
 		 539 aa  584  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0905  L-aspartate oxidase  56.87 
 
 		 541 aa  584  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  54.53 
 
 		 533 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  55.36 
 
 		 534 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2447  L-aspartate oxidase  57 
 
 		 533 aa  579  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4130  L-aspartate oxidase  55.51 
 
 		 532 aa  580  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0478415  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  54.81 
 
 		 533 aa  580  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2715  L-aspartate oxidase  57.36 
 
 		 533 aa  581  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  56.31 
 
 		 535 aa  578  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  55.26 
 
 		 540 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  55.71 
 
 		 540 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0976  L-aspartate oxidase  55.79 
 
 		 570 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  55.26 
 
 		 540 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  55.51 
 
 		 540 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2233  L-aspartate oxidase  55.79 
 
 		 535 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2532  L-aspartate oxidase  54.48 
 
 		 538 aa  575  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  55.26 
 
 		 540 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  56.31 
 
 		 528 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1134  L-aspartate oxidase  56.03 
 
 		 533 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2103  L-aspartate oxidase  55.79 
 
 		 570 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2325  L-aspartate oxidase  57.17 
 
 		 533 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0233032 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0980  L-aspartate oxidase  55.79 
 
 		 570 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2649  L-aspartate oxidase  55.79 
 
 		 570 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1024  L-aspartate oxidase  55.79 
 
 		 570 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105043  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  55.07 
 
 		 540 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03007  L-aspartate oxidase  55.32 
 
 		 561 aa  574  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00568671  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0778  L-aspartate oxidase  55.75 
 
 		 533 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  53.31 
 
 		 531 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3031  L-aspartate oxidase  57.14 
 
 		 536 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  55.62 
 
 		 540 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3812  L-aspartate oxidase  54.98 
 
 		 530 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0403112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3493  L-aspartate oxidase  56.01 
 
 		 529 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3677  L-aspartate oxidase  54.44 
 
 		 545 aa  573  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.341127  normal  0.20063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>