More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1530 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  100 
 
 		 591 aa  1192    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  45.73 
 
 		 589 aa  501  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  44.44 
 
 		 588 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  42.66 
 
 		 588 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  44.87 
 
 		 588 aa  462  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  41.72 
 
 		 589 aa  451  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  42.14 
 
 		 588 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  45.01 
 
 		 587 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  40.85 
 
 		 592 aa  430  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  41.37 
 
 		 588 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  43.41 
 
 		 591 aa  415  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  37.33 
 
 		 583 aa  395  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  36.73 
 
 		 634 aa  370  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  37.04 
 
 		 575 aa  365  1e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  36.12 
 
 		 593 aa  365  1e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  36.49 
 
 		 622 aa  356  6.999999999999999e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1424  TrkA domain-containing protein  37.58 
 
 		 575 aa  355  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0976124  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  37.11 
 
 		 574 aa  350  3e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  36.81 
 
 		 575 aa  350  6e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1688  TrkA domain-containing protein  35.58 
 
 		 575 aa  349  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0799  potasium uptake protein  37.33 
 
 		 575 aa  343  5e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652417 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  37.61 
 
 		 574 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  36.13 
 
 		 579 aa  340  5e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  39.29 
 
 		 575 aa  339  8e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  35.67 
 
 		 588 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  34.77 
 
 		 574 aa  335  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  33.11 
 
 		 588 aa  335  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  32.65 
 
 		 602 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  32.94 
 
 		 596 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  35.8 
 
 		 598 aa  330  4e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  35.58 
 
 		 596 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  34.47 
 
 		 574 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  32.58 
 
 		 597 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  34.47 
 
 		 575 aa  324  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  36.1 
 
 		 574 aa  324  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  35.25 
 
 		 574 aa  324  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3070  TrkA domain-containing protein  37.46 
 
 		 574 aa  320  5e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.748598 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0865  TrkA domain-containing protein  37.12 
 
 		 574 aa  318  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  34.51 
 
 		 583 aa  317  3e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  32.71 
 
 		 592 aa  316  7e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  32.1 
 
 		 596 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  35.42 
 
 		 574 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  35.42 
 
 		 574 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0956  TrkA-C domain protein  35.25 
 
 		 574 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  32.1 
 
 		 596 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14922  predicted protein  35.83 
 
 		 572 aa  311  2.9999999999999997e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00768  hypothetical protein  34.47 
 
 		 574 aa  311  2.9999999999999997e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0902  TrkA domain-containing protein  37.46 
 
 		 574 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  34.01 
 
 		 592 aa  307  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  36.93 
 
 		 593 aa  306  5.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  33.95 
 
 		 592 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  33.95 
 
 		 592 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1395  TrkA-C domain protein  39.31 
 
 		 578 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.096414  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  33.78 
 
 		 592 aa  302  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  32.94 
 
 		 607 aa  300  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1647  TrkA-C  36.15 
 
 		 575 aa  301  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  34.05 
 
 		 623 aa  296  1e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  31.55 
 
 		 605 aa  289  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  33.28 
 
 		 601 aa  287  2.9999999999999996e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  33.84 
 
 		 592 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  33.84 
 
 		 592 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  32.59 
 
 		 622 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02717  putative transporter  34.02 
 
 		 574 aa  283  6.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  32.58 
 
 		 599 aa  281  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  32.21 
 
 		 613 aa  280  4e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  31.09 
 
 		 592 aa  277  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  34.52 
 
 		 599 aa  274  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  31.81 
 
 		 624 aa  273  6e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  35.28 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  32.61 
 
 		 627 aa  272  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  32.14 
 
 		 618 aa  270  5.9999999999999995e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  30.05 
 
 		 612 aa  270  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  32.76 
 
 		 606 aa  270  7e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  29.66 
 
 		 605 aa  266  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  29.66 
 
 		 605 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  30.85 
 
 		 609 aa  264  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  30.61 
 
 		 609 aa  263  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  30.38 
 
 		 616 aa  263  8e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  29.44 
 
 		 593 aa  260  6e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  29.85 
 
 		 613 aa  258  3e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  31.13 
 
 		 596 aa  257  5e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  32.56 
 
 		 608 aa  252  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  29.19 
 
 		 632 aa  248  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  32.67 
 
 		 618 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  29.86 
 
 		 602 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  29.86 
 
 		 602 aa  241  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  29.97 
 
 		 602 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  29.4 
 
 		 608 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  29.86 
 
 		 605 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  29.81 
 
 		 596 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  31.47 
 
 		 602 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  30.22 
 
 		 609 aa  233  9e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  30.26 
 
 		 619 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3434  TrkA-C  28.29 
 
 		 603 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0196864  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  27.97 
 
 		 641 aa  231  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  27.61 
 
 		 590 aa  230  6e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  28.87 
 
 		 620 aa  229  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3584  TrkA-C domain protein  27.93 
 
 		 609 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  28.31 
 
 		 609 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  26.42 
 
 		 588 aa  226  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>