More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1452 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  100 
 
 		 1464 aa  2980    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  29.4 
 
 		 1599 aa  340  9e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  30.96 
 
 		 1681 aa  246  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27.51 
 
 		 1600 aa  240  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.04 
 
 		 1558 aa  225  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  26.66 
 
 		 1352 aa  224  9e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  29.73 
 
 		 1710 aa  216  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  26.47 
 
 		 2096 aa  211  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.77 
 
 		 1271 aa  210  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00354  putative RHS-related transmembrane protein  29.54 
 
 		 1368 aa  203  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  26.21 
 
 		 2277 aa  199  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  28.12 
 
 		 2294 aa  192  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  28.99 
 
 		 1935 aa  189  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2045  YD repeat-containing protein  33.01 
 
 		 740 aa  188  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2046  YD repeat-containing protein  31.2 
 
 		 909 aa  184  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  26.4 
 
 		 1008 aa  182  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  26.88 
 
 		 1959 aa  182  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  26.4 
 
 		 1008 aa  182  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  24.31 
 
 		 2149 aa  182  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  26.3 
 
 		 1345 aa  181  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  26.3 
 
 		 1345 aa  181  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  26.23 
 
 		 1485 aa  180  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2048  YD repeat-containing protein  29.42 
 
 		 972 aa  177  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  25.5 
 
 		 1917 aa  176  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  24.12 
 
 		 1942 aa  176  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  24.49 
 
 		 1840 aa  174  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.25 
 
 		 3027 aa  173  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  28.03 
 
 		 2003 aa  169  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  24.61 
 
 		 1669 aa  167  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  26.02 
 
 		 1732 aa  167  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.05 
 
 		 2035 aa  164  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2152  YD repeat protein  25.84 
 
 		 1912 aa  162  6e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0482725 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  25.19 
 
 		 2942 aa  161  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  23.3 
 
 		 1410 aa  160  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0036  YD repeat protein  25.67 
 
 		 1957 aa  160  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.13873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  23.83 
 
 		 1614 aa  158  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  25.25 
 
 		 927 aa  158  9e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  25.16 
 
 		 1488 aa  157  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0983  YD repeat protein  25.73 
 
 		 1929 aa  155  5.9999999999999996e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.984855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  25.78 
 
 		 3073 aa  155  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  25.06 
 
 		 1485 aa  151  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  25.13 
 
 		 1381 aa  151  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  30.58 
 
 		 678 aa  150  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0735  YD repeat protein  26.1 
 
 		 1938 aa  146  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.206584  normal  0.0550996 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  26.62 
 
 		 690 aa  145  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1143  YD repeat protein  24.35 
 
 		 1991 aa  143  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0172483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  23.91 
 
 		 1197 aa  142  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  24.62 
 
 		 1390 aa  142  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  23.05 
 
 		 1576 aa  142  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  22.88 
 
 		 1386 aa  141  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  23.3 
 
 		 1384 aa  140  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  26.2 
 
 		 1467 aa  140  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  23.85 
 
 		 3689 aa  140  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  25.98 
 
 		 2731 aa  140  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  26.98 
 
 		 2349 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  24.92 
 
 		 2225 aa  139  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  23.88 
 
 		 1531 aa  139  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  23.48 
 
 		 1551 aa  138  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  24.92 
 
 		 1520 aa  138  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  23.82 
 
 		 765 aa  138  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  23.95 
 
 		 1362 aa  138  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  25 
 
 		 2246 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  22 
 
 		 1400 aa  137  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  24.6 
 
 		 1528 aa  137  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  24 
 
 		 1527 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  25 
 
 		 2178 aa  136  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  25.79 
 
 		 2224 aa  136  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  22.78 
 
 		 1509 aa  135  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  24.44 
 
 		 2221 aa  135  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  23.53 
 
 		 1348 aa  135  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  24.56 
 
 		 2224 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  24.95 
 
 		 1550 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  24.56 
 
 		 2224 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  24.02 
 
 		 1609 aa  134  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  24.34 
 
 		 1953 aa  134  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  24.42 
 
 		 3193 aa  134  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  25.93 
 
 		 869 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  24.67 
 
 		 2350 aa  133  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  23.05 
 
 		 1379 aa  133  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  22.12 
 
 		 1595 aa  132  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  30.14 
 
 		 396 aa  133  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  22.12 
 
 		 1586 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  26.77 
 
 		 2658 aa  132  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  26.69 
 
 		 765 aa  131  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  21.59 
 
 		 1385 aa  131  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  23.16 
 
 		 1434 aa  129  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  21.6 
 
 		 1411 aa  129  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  25.03 
 
 		 1518 aa  129  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  22.78 
 
 		 1572 aa  128  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  25.22 
 
 		 1763 aa  125  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.26 
 
 		 903 aa  125  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  22.39 
 
 		 1418 aa  125  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  23.68 
 
 		 1517 aa  124  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  24.32 
 
 		 924 aa  122  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  21.45 
 
 		 1409 aa  122  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  23.58 
 
 		 1495 aa  122  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  22.56 
 
 		 1402 aa  121  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  23.33 
 
 		 1368 aa  121  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  24.06 
 
 		 1611 aa  121  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  25.03 
 
 		 913 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>