More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1371 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 130 aa  265  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  85.5 
 
 		 131 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  88.7 
 
 		 131 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  88.7 
 
 		 131 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  86.09 
 
 		 131 aa  217  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  74.38 
 
 		 129 aa  200  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  74.38 
 
 		 129 aa  200  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  73.02 
 
 		 128 aa  200  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  74.38 
 
 		 129 aa  200  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  74.38 
 
 		 129 aa  200  6e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  74.38 
 
 		 129 aa  200  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  78.45 
 
 		 129 aa  199  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3303  30S ribosomal protein S11  89.57 
 
 		 131 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332144 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0958  30S ribosomal protein S11  89.57 
 
 		 131 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  71.54 
 
 		 129 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  73.55 
 
 		 129 aa  197  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  70.23 
 
 		 131 aa  197  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  73.55 
 
 		 129 aa  197  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  73.55 
 
 		 129 aa  197  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  75.38 
 
 		 130 aa  196  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  76.72 
 
 		 129 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  76.72 
 
 		 129 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  70.31 
 
 		 129 aa  194  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  70.31 
 
 		 129 aa  194  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  73.55 
 
 		 129 aa  194  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  73.55 
 
 		 129 aa  194  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  70.31 
 
 		 129 aa  194  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  70.31 
 
 		 129 aa  194  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0726  30S ribosomal protein S11  78.57 
 
 		 131 aa  194  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873114  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  77.59 
 
 		 137 aa  192  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  192  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  70.87 
 
 		 129 aa  192  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  72.73 
 
 		 129 aa  192  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  71.9 
 
 		 129 aa  191  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  71.07 
 
 		 130 aa  192  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  71.9 
 
 		 129 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  70.08 
 
 		 129 aa  191  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  71.9 
 
 		 129 aa  191  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  71.9 
 
 		 130 aa  191  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  71.07 
 
 		 130 aa  190  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  71.07 
 
 		 129 aa  190  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  71.07 
 
 		 129 aa  187  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  71.07 
 
 		 129 aa  187  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 130 aa  187  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  186  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  68.22 
 
 		 131 aa  185  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  74.14 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  67.19 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2751  ribosomal protein S11  70.77 
 
 		 129 aa  183  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  67.77 
 
 		 132 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0616  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  182  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 133 aa  181  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  70.54 
 
 		 134 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  71.32 
 
 		 139 aa  181  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2930  30S ribosomal protein S11  71.54 
 
 		 134 aa  180  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000145745  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  68.6 
 
 		 131 aa  179  8.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  67.69 
 
 		 130 aa  179  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  65.62 
 
 		 130 aa  179  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 129 aa  178  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  70.54 
 
 		 134 aa  178  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 133 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 133 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0424  ribosomal protein S11  68.1 
 
 		 132 aa  177  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  74.38 
 
 		 138 aa  177  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 		 134 aa  177  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1458  30S ribosomal protein S11  70.31 
 
 		 129 aa  177  4e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000430937  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 		 134 aa  177  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4481  30S ribosomal protein S11  71.9 
 
 		 135 aa  177  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.401787  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 		 134 aa  177  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 133 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  72.73 
 
 		 128 aa  177  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 129 aa  176  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2151  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 129 aa  176  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000057735  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  66.94 
 
 		 129 aa  176  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000259501  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0082  30S ribosomal protein S11  67.77 
 
 		 129 aa  176  8e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000625128  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1882  30S ribosomal protein S11  71.54 
 
 		 127 aa  176  8e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  64.06 
 
 		 130 aa  176  9e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2528  30S ribosomal protein S11  67.72 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.481275  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  68.46 
 
 		 137 aa  176  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0604  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650942  normal  0.687917 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3799  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0428  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.684596  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4972  30S ribosomal protein S11  68.46 
 
 		 136 aa  175  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3892  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  71.9 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>