More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1365 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  100 
 
 		 149 aa  299  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  69.86 
 
 		 146 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  69.86 
 
 		 146 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  69.86 
 
 		 146 aa  208  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  69.44 
 
 		 147 aa  205  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  67.35 
 
 		 148 aa  203  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  71.43 
 
 		 148 aa  202  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  68.03 
 
 		 147 aa  194  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  55.1 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  55.86 
 
 		 147 aa  163  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  58.22 
 
 		 146 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 146 aa  159  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 146 aa  159  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  55.48 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  56.76 
 
 		 148 aa  158  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 146 aa  157  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  56.16 
 
 		 146 aa  157  3e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 146 aa  157  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 146 aa  157  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 146 aa  157  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 146 aa  157  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 146 aa  157  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 146 aa  157  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  55.48 
 
 		 146 aa  157  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 		 146 aa  157  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 146 aa  156  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  56.85 
 
 		 149 aa  156  8e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  55.1 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  51.68 
 
 		 149 aa  154  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  52.41 
 
 		 147 aa  151  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 147 aa  150  4e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 146 aa  149  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  51.37 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  52.78 
 
 		 146 aa  147  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 146 aa  148  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0866  50S ribosomal protein L15P  57.24 
 
 		 157 aa  147  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380263  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 144 aa  143  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  56.25 
 
 		 176 aa  141  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 147 aa  141  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  51.39 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  51.39 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  52.08 
 
 		 144 aa  140  5e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  53.06 
 
 		 144 aa  140  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  48.98 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  47.26 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  48.95 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  48.63 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0620  ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 144 aa  136  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527453  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0516  50S ribosomal protein L15  49.31 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.061752  unclonable  0.0000000000147617 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000129799  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0346  50S ribosomal protein L15  49.31 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0978  50S ribosomal protein L15  52.78 
 
 		 144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00708309  hitchhiker  0.00387669 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  49.31 
 
 		 144 aa  134  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  49.33 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  48.03 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  47.74 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  48.99 
 
 		 152 aa  133  7.000000000000001e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001723  LSU ribosomal protein L15p (L27Ae)  48.98 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000210638  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 159 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 		 159 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 172 aa  132  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  47.68 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2159  ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 149 aa  130  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211947  normal  0.600451 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  47.97 
 
 		 148 aa  130  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00957  50S ribosomal protein L15  47.62 
 
 		 144 aa  130  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0550522  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  51.33 
 
 		 150 aa  130  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0342  ribosomal protein L15  48.61 
 
 		 142 aa  130  7.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000342315  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  45.21 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0339  50S ribosomal protein L15  47.22 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.003773  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0477  50S ribosomal protein L15  47.92 
 
 		 144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2382  50S ribosomal protein L15  51.72 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000043437  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2305  ribosomal protein L15  51.39 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1919  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2155  50S ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156798  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1142  ribosomal protein L15  54.11 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000449259  normal  0.0114538 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3505  ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000855163  hitchhiker  0.0000000902196 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23280  LSU ribosomal protein L15P  56.85 
 
 		 149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.332048  hitchhiker  0.00000574627 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4257  ribosomal protein L15  49.31 
 
 		 144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000785215  unclonable  0.00000000000230267 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00749  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 144 aa  127  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0298  50S ribosomal protein L15P  47.55 
 
 		 144 aa  127  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000286334  hitchhiker  0.00000213592 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 149 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>