More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1360 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  100 
 
 		 132 aa  268  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  81.06 
 
 		 132 aa  231  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  78.79 
 
 		 132 aa  224  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  76.52 
 
 		 132 aa  221  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  78.03 
 
 		 132 aa  220  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3314  30S ribosomal protein S8  75 
 
 		 132 aa  215  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0947  30S ribosomal protein S8  75 
 
 		 132 aa  215  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0715  30S ribosomal protein S8  62.88 
 
 		 132 aa  183  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000123217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 		 132 aa  170  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  59.85 
 
 		 132 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  59.23 
 
 		 134 aa  168  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 132 aa  167  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  57.69 
 
 		 130 aa  165  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 132 aa  165  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  59.09 
 
 		 132 aa  164  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 132 aa  163  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  163  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1380  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 		 134 aa  161  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00507298  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1306  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 		 134 aa  161  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000833036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 131 aa  160  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 132 aa  160  8.000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  159  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  159  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0967  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 134 aa  159  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0820886  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1170  ribosomal protein S8  55.97 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  158  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  156  9e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 131 aa  156  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  53.79 
 
 		 132 aa  156  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  54.14 
 
 		 133 aa  155  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1404  ribosomal protein S8  56.59 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 134 aa  155  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  59.09 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0722  ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 132 aa  151  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0472  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 131 aa  150  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1124  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.176656  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0973  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000165521  hitchhiker  0.000000973471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3991  ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246659  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 		 132 aa  149  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4229  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 131 aa  148  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00128443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0640  ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000305932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4534  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000327382  normal  0.123392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5065  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000451262  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  54.2 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0844  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 133 aa  145  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  52.31 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1240  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 133 aa  145  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.455541  hitchhiker  0.000777173 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000392794  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0395  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00245288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0387  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000185574  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000001061  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0281  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00164678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0362  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000109852  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5056  ribosomal protein S8  54.2 
 
 		 131 aa  143  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00882416  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3461  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 131 aa  143  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000315626  decreased coverage  0.00455507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0489  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 131 aa  143  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000854539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0328  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 131 aa  144  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000354136  decreased coverage  0.00289436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3630  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 131 aa  144  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000497619  decreased coverage  0.00000000000124793 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3429  SSU ribosomal protein S8P  56.49 
 
 		 131 aa  144  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401313  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0435  SSU ribosomal protein S8P  52.27 
 
 		 130 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0495353  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08990  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 130 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000305934  normal  0.17912 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0419  SSU ribosomal protein S8P  54.96 
 
 		 131 aa  143  9e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00478629  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0263  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000657656  hitchhiker  0.00182938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3895  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000590966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2311  30S ribosomal protein S8  54.2 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0101074  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3935  ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 131 aa  141  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>