268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1329 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3313  thiolase, putative  70.7 
 
 
535 aa  787    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.795439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0144  thiolase, putative  70.13 
 
 
535 aa  774    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1329  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  100 
 
 
532 aa  1092    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000533085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0644  thiolase, putative  63.72 
 
 
534 aa  711    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.4394300000000005e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0630  thiolase, putative  64.29 
 
 
534 aa  714    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0734  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  70.86 
 
 
541 aa  783    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000338531  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  31.81 
 
 
388 aa  156  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  32.5 
 
 
388 aa  155  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31 
 
 
395 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.38 
 
 
383 aa  143  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  32.22 
 
 
387 aa  141  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  30.29 
 
 
387 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.09 
 
 
389 aa  133  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  27.91 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  30.77 
 
 
387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  30.03 
 
 
388 aa  131  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  30.64 
 
 
386 aa  130  9.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.72 
 
 
387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.39 
 
 
376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  28.8 
 
 
384 aa  127  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  28.84 
 
 
390 aa  125  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  29.12 
 
 
390 aa  125  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  29.15 
 
 
391 aa  125  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  31.12 
 
 
387 aa  124  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  28.9 
 
 
392 aa  124  4e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  29.1 
 
 
388 aa  124  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  28.68 
 
 
387 aa  123  7e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  26.32 
 
 
386 aa  120  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  29.51 
 
 
390 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  27.09 
 
 
378 aa  119  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  30.12 
 
 
386 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30 
 
 
384 aa  118  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.15 
 
 
386 aa  118  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.28 
 
 
387 aa  117  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  31.01 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  29.37 
 
 
387 aa  115  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  30.65 
 
 
394 aa  113  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  26.4 
 
 
395 aa  113  9e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  28.66 
 
 
392 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  31.58 
 
 
387 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  28.35 
 
 
392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  28.23 
 
 
396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0459  acetyl-CoA acetyltransferase  28.35 
 
 
392 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221902  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0021  acetyl-CoA acetyltransferase  28.88 
 
 
394 aa  109  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  30.46 
 
 
388 aa  107  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0527  acetyl-CoA acetyltransferase  27.48 
 
 
392 aa  107  7e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.191077  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  31.91 
 
 
388 aa  106  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  29.05 
 
 
388 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0813  acetyl-CoA C-acyltransferase  26.94 
 
 
368 aa  104  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000183957 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.83 
 
 
392 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  30.67 
 
 
390 aa  100  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.1 
 
 
392 aa  99  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0795  acetyl-CoA C-acyltransferase  25.51 
 
 
369 aa  99  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1084  acetyl-CoA C-acyltransferase  25.51 
 
 
368 aa  99  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1358  acetyl-CoA C-acyltransferase  25.97 
 
 
368 aa  99.4  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.7 
 
 
392 aa  99  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.02 
 
 
394 aa  97.4  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  29.23 
 
 
387 aa  96.7  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  31.44 
 
 
394 aa  94  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  28.94 
 
 
388 aa  94.4  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6077  acetyl-CoA acetyltransferase  28.19 
 
 
390 aa  94  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.07 
 
 
388 aa  90.9  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  29.05 
 
 
395 aa  90.5  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3070  acetyl-CoA acetyltransferase  27.78 
 
 
400 aa  89.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.430335 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  31.23 
 
 
397 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1242  acetyl-CoA C-acyltransferase  27.42 
 
 
380 aa  88.2  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0529567  normal  0.0106911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1855  acetyl-CoA acetyltransferase  26.1 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0446253  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  26.55 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5352  acetyl-CoA acetyltransferase  25.41 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  0.485306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1335  acetyl-CoA acetyltransferase  27.23 
 
 
460 aa  84.7  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1608  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoAthiolase) (AcaB-1)  25 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  27.66 
 
 
389 aa  84  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  28.21 
 
 
398 aa  83.2  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672752  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  28.43 
 
 
389 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  26.26 
 
 
392 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  26.14 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2244  acetyl-CoA acetyltransferase  29.73 
 
 
388 aa  82  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106872  normal  0.0160959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  29.73 
 
 
394 aa  82  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.845953  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2644  acetyl-CoA acetyltransferase  29.34 
 
 
391 aa  82  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000531608  normal  0.301355 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2734  acetyl-CoA acetyltransferase  26.22 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  28.31 
 
 
386 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  24.87 
 
 
417 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2841  acetyl-CoA acetyltransferase  28.22 
 
 
392 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3283  acetyl-CoA acetyltransferase  29.14 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2397  acetyl-CoA acetyltransferase  27.51 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0429  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  26.83 
 
 
386 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413343  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3966  propanoyl-CoA C-acyltransferase  27.35 
 
 
392 aa  78.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.238561  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  31 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2763  putative SCP-x_thiolase/acetyl- CoA acetyltransferase, PaaJ-like  25 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470356  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  26.02 
 
 
388 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2056  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.28 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0124165  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3981  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  27.59 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.480226  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1484  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  26.76 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4819  acetyl-CoA acetyltransferase  27.01 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.098551  normal  0.333333 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0841  propanoyl-CoA C-acyltransferase  22.11 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000470716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.82 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2370  acetyl-CoA acetyltransferase  26.7 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2916  acetyl-CoA acetyltransferase  27.59 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.614429  normal  0.0144444 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  26.76 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  27.91 
 
 
382 aa  72.8  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.263214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>