More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1319 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  47.08 
 
 
679 aa  657    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  47.51 
 
 
692 aa  677    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  78.32 
 
 
697 aa  1123    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  48.1 
 
 
692 aa  675    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  48.46 
 
 
697 aa  676    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  45.53 
 
 
693 aa  653    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  47.26 
 
 
698 aa  646    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  100 
 
 
694 aa  1431    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1921  elongation factor G  46.68 
 
 
700 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000761917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  47.95 
 
 
692 aa  679    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  81.54 
 
 
701 aa  1196    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  45.93 
 
 
692 aa  639    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  45.89 
 
 
692 aa  660    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  47.74 
 
 
689 aa  674    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  47.8 
 
 
692 aa  678    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  47.8 
 
 
692 aa  678    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3172  elongation factor G  46.68 
 
 
700 aa  636    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361856  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  48.09 
 
 
692 aa  681    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  76.33 
 
 
697 aa  1124    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2635  elongation factor G  46.68 
 
 
700 aa  636    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00747031  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  46.15 
 
 
694 aa  644    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  46.15 
 
 
694 aa  644    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  47.51 
 
 
692 aa  677    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  47.19 
 
 
704 aa  637    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  46.36 
 
 
691 aa  645    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  46.94 
 
 
695 aa  658    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  49.2 
 
 
686 aa  683    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  46.83 
 
 
673 aa  653    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  47.8 
 
 
692 aa  679    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  46.68 
 
 
700 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  47.04 
 
 
697 aa  661    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  44.82 
 
 
692 aa  644    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  57.66 
 
 
692 aa  848    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3444  elongation factor G  46.82 
 
 
700 aa  636    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000177525  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  47.8 
 
 
692 aa  679    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  43.97 
 
 
699 aa  635    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  46.36 
 
 
692 aa  662    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  46.08 
 
 
693 aa  656    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  45.71 
 
 
697 aa  652    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  47.67 
 
 
692 aa  670    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  76.16 
 
 
697 aa  1113    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  47.01 
 
 
691 aa  665    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  50 
 
 
686 aa  695    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  47.8 
 
 
692 aa  678    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  48.97 
 
 
689 aa  686    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  46.61 
 
 
690 aa  643    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  46.24 
 
 
696 aa  647    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  45.31 
 
 
689 aa  635    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  49.5 
 
 
680 aa  683    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  50.87 
 
 
692 aa  708    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  48.09 
 
 
691 aa  689    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  46.68 
 
 
700 aa  636    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  45.78 
 
 
697 aa  663    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  47.59 
 
 
698 aa  640    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  47.15 
 
 
692 aa  649    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  47.18 
 
 
697 aa  642    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0324  elongation factor G  46.68 
 
 
700 aa  636    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00564924  normal  0.0493558 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  47.51 
 
 
691 aa  659    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  45.69 
 
 
692 aa  649    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0793  elongation factor G  47.25 
 
 
701 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  50 
 
 
687 aa  672    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  50.44 
 
 
691 aa  702    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  47.59 
 
 
698 aa  639    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  47.8 
 
 
692 aa  679    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  46.5 
 
 
697 aa  659    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  45.6 
 
 
701 aa  658    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2103  elongation factor G  49.49 
 
 
688 aa  647    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  47.65 
 
 
692 aa  680    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2843  elongation factor G  46.89 
 
 
700 aa  641    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52933  normal  0.221266 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  47.29 
 
 
692 aa  666    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  45.01 
 
 
699 aa  644    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  45.43 
 
 
697 aa  660    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  46.82 
 
 
700 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  50.29 
 
 
688 aa  679    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  49.49 
 
 
692 aa  719    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  48.55 
 
 
695 aa  682    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  45.43 
 
 
697 aa  659    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  47.24 
 
 
692 aa  665    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  48.12 
 
 
694 aa  637    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3749  elongation factor G  46.68 
 
 
700 aa  636    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00154253  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  81.69 
 
 
701 aa  1177    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  49.93 
 
 
682 aa  688    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0264  elongation factor G  46.68 
 
 
700 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  46.35 
 
 
692 aa  656    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  44.86 
 
 
699 aa  643    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  44.95 
 
 
698 aa  642    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  46.17 
 
 
693 aa  655    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0345  elongation factor G  46.68 
 
 
700 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  45.53 
 
 
695 aa  641    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  54.01 
 
 
691 aa  784    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  46.28 
 
 
707 aa  649    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3807  elongation factor G  46.68 
 
 
700 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  43.97 
 
 
699 aa  635    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  46.74 
 
 
700 aa  643    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  46.48 
 
 
695 aa  640    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  84.15 
 
 
694 aa  1229    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  48.61 
 
 
692 aa  684    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  48.09 
 
 
692 aa  681    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0273  elongation factor G  46.53 
 
 
700 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823209  normal  0.369004 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  46.37 
 
 
692 aa  660    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>