67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1315 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  677    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  57.36 
 
 
340 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  57.19 
 
 
340 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  54.87 
 
 
340 aa  371  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  54.12 
 
 
340 aa  354  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  55.21 
 
 
343 aa  344  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  52.99 
 
 
337 aa  310  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  44.9 
 
 
717 aa  255  7e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  46.51 
 
 
330 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  47.69 
 
 
329 aa  242  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  45.09 
 
 
330 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  44.02 
 
 
329 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  39.65 
 
 
479 aa  229  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  37.39 
 
 
711 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  41.82 
 
 
709 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  42.11 
 
 
254 aa  182  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  43.36 
 
 
252 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1385  hypothetical protein  44.83 
 
 
181 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.522055  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1150  hypothetical protein  51.9 
 
 
100 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00196806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0469  hypothetical protein  52.56 
 
 
102 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  25.87 
 
 
655 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2745  hypothetical protein  28.94 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1082  hypothetical protein  29.34 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15012e-18 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2720  hypothetical protein  25.36 
 
 
580 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.44099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3996  hypothetical protein  27.27 
 
 
256 aa  63.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000934888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0729  hypothetical protein  48 
 
 
102 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000019285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0716  hypothetical protein  46.67 
 
 
102 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3997  hypothetical protein  27.31 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3348  hypothetical protein  38.1 
 
 
126 aa  56.6  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000670369  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1084  hypothetical protein  27.59 
 
 
277 aa  55.8  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18348e-17 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0597  hypothetical protein  23.48 
 
 
288 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000303858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  22.36 
 
 
884 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1433  hypothetical protein  36.9 
 
 
106 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000304955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  23.08 
 
 
712 aa  53.1  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0584  hypothetical protein  22.13 
 
 
285 aa  52.8  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4131  hypothetical protein  36.36 
 
 
160 aa  52.8  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2767  hypothetical protein  31.63 
 
 
125 aa  52.8  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000252598  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  27.06 
 
 
344 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3254  hypothetical protein  27.38 
 
 
267 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163146  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  27.06 
 
 
344 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3546  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  28.06 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00250454  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  34.18 
 
 
350 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  26.8 
 
 
215 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1959  hypothetical protein  45.07 
 
 
112 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.563313  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  24.17 
 
 
287 aa  50.4  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4126  hypothetical protein  36.23 
 
 
130 aa  49.7  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686077 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1874  hypothetical protein  45.07 
 
 
112 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2839  cytochrome c family protein  24.71 
 
 
289 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000361793  decreased coverage  9.49573e-22 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2004  hypothetical protein  43.66 
 
 
112 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1803  hypothetical protein  42.25 
 
 
113 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.20863  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  29.1 
 
 
219 aa  46.6  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  21.59 
 
 
806 aa  46.6  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  23.55 
 
 
600 aa  46.2  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  30.83 
 
 
344 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  25.35 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0523  cytochrome c family protein  26.54 
 
 
259 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  23.71 
 
 
1009 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4127  hypothetical protein  34.43 
 
 
199 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  23.12 
 
 
867 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  22.87 
 
 
1017 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  27.91 
 
 
655 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  27.91 
 
 
655 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  29.05 
 
 
557 aa  43.9  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2645  cytochrome c family protein  26.29 
 
 
291 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  36 
 
 
567 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  24.01 
 
 
1330 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  24.46 
 
 
435 aa  42.7  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>