More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1308 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
308 aa  604  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461902  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  66.22 
 
 
304 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.51 
 
 
308 aa  343  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.12 
 
 
308 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  60.81 
 
 
309 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  55.67 
 
 
305 aa  331  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  57.67 
 
 
308 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  34.94 
 
 
295 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0944  hypothetical protein  28.11 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  31.09 
 
 
319 aa  126  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  31.94 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  34.44 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  29.45 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  34.94 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.5 
 
 
302 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  29.02 
 
 
298 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.49 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.92 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  33.21 
 
 
298 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  30.34 
 
 
293 aa  113  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.96 
 
 
289 aa  112  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  27.37 
 
 
301 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.93 
 
 
294 aa  109  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.84 
 
 
290 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  31.25 
 
 
358 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.37 
 
 
301 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  32.86 
 
 
316 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  25.52 
 
 
288 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
312 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  33.7 
 
 
314 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  25.09 
 
 
288 aa  103  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.64 
 
 
300 aa  102  8e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 
296 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  32.47 
 
 
307 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  26.67 
 
 
310 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  30.04 
 
 
296 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  29.59 
 
 
307 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 
296 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  27.37 
 
 
282 aa  99.8  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  30.86 
 
 
307 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1470  hypothetical protein  29.1 
 
 
323 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635983  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2437  hypothetical protein  29.1 
 
 
306 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 
343 aa  99.4  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0290  hypothetical protein  29.1 
 
 
306 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0875  hypothetical protein  29.1 
 
 
306 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  30.86 
 
 
307 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0322  hypothetical protein  29.1 
 
 
306 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698998  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1667  hypothetical protein  29.1 
 
 
306 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2573  multidrug ABC transporter permease  29.1 
 
 
306 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  27.3 
 
 
302 aa  99.4  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  27.96 
 
 
323 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  29.59 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  27.3 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  29.59 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  27.3 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  29.59 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  26.57 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.84 
 
 
293 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.98 
 
 
315 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  31.93 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  28.09 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  30.8 
 
 
312 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2243  hypothetical protein  29.96 
 
 
307 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0582742 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  26.59 
 
 
286 aa  96.7  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.35 
 
 
297 aa  96.7  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  26.45 
 
 
292 aa  95.9  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  26.15 
 
 
295 aa  96.3  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  29.53 
 
 
305 aa  95.9  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  28.94 
 
 
299 aa  95.9  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0586  hypothetical protein  28.68 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0483784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  28.52 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.8 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  25.8 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  29.33 
 
 
311 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.51 
 
 
252 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3309  hypothetical protein  32.86 
 
 
316 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.46 
 
 
292 aa  93.6  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  28.16 
 
 
297 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.06 
 
 
287 aa  92.8  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  27.59 
 
 
298 aa  92.4  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.86 
 
 
312 aa  92.4  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.32 
 
 
302 aa  90.9  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  29.79 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.68 
 
 
283 aa  91.3  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.63 
 
 
308 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  26.47 
 
 
277 aa  90.9  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  26.6 
 
 
299 aa  90.5  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1619  integral membrane protein  25.19 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.971889  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  29.22 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  24.91 
 
 
303 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  26.37 
 
 
303 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  26.37 
 
 
303 aa  89.7  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  26.37 
 
 
303 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  25.09 
 
 
336 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  26.37 
 
 
303 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  26.37 
 
 
303 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.97 
 
 
302 aa  89.7  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 
304 aa  89  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  24.91 
 
 
303 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>