30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1296 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1296  gamma-BHC dehydrochlorinase  100 
 
 		 224 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.956096  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  31.18 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  27.84 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  29.09 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  28.25 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5505  hypothetical protein  28.57 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1786  hypothetical protein  28 
 
 		 172 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.257268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  28.8 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  28.8 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  28.8 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  28.8 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  28.49 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  29.2 
 
 		 182 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  28.98 
 
 		 174 aa  52  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  28.99 
 
 		 179 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  26.67 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  28.66 
 
 		 358 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  30 
 
 		 182 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  25.13 
 
 		 185 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  30.99 
 
 		 174 aa  48.5  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  25.97 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  23.94 
 
 		 185 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  28.06 
 
 		 450 aa  45.4  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  25.28 
 
 		 185 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  27.46 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  26.5 
 
 		 190 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  29.24 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  24.82 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  27.27 
 
 		 181 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  28.15 
 
 		 135 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>