26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1260 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1260  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
616 aa  1240    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.126899  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0646  TPR repeat-containing protein  43.12 
 
 
611 aa  458  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0665559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1635  TPR repeat-containing protein  34.6 
 
 
665 aa  317  4e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0192476  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1698  TPR domain-containing protein  36.69 
 
 
626 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2071  TPR repeat-containing protein  40.21 
 
 
757 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1322  TPR repeat-containing protein  46.46 
 
 
627 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.993956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2961  Tetratricopeptide domain protein  43.58 
 
 
635 aa  167  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.445649 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1302  TPR domain-containing protein  34.08 
 
 
846 aa  160  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0696  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 
893 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0685  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.2 
 
 
883 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0651  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 
878 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10746  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0258  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 
974 aa  107  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4380  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 
900 aa  88.6  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.87 
 
 
810 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0090  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 
1090 aa  51.2  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.763002  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 
934 aa  50.4  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.88 
 
 
602 aa  50.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0583  diguanylate cyclase with GAF sensor  24.77 
 
 
870 aa  48.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1443  hypothetical protein  27.27 
 
 
460 aa  47.4  0.0009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113493  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 
767 aa  47.4  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 
878 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 
3172 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 
629 aa  44.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
3301 aa  44.3  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 
870 aa  43.9  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2761  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 
468 aa  43.9  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.594013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>