More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1149 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1149  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
856 aa  1775    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000213682  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0643  molybdopterin oxidoreductase  48.84 
 
 
866 aa  837    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  55.88 
 
 
843 aa  997    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2341  molybdopterin oxidoreductase  48.09 
 
 
854 aa  827    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.064973  normal  0.0429388 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3826  molybdopterin oxidoreductase  48.09 
 
 
854 aa  827    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0470  molybdopterin oxidoreductase  80.09 
 
 
855 aa  1423    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  29.91 
 
 
833 aa  335  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  31.08 
 
 
837 aa  332  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2426  molybdopterin oxidoreductase  29.95 
 
 
826 aa  311  5e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.242196 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  26.78 
 
 
764 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  26.12 
 
 
730 aa  190  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  25.58 
 
 
758 aa  181  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  24.68 
 
 
758 aa  180  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  24.68 
 
 
760 aa  179  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  24.68 
 
 
758 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  24.89 
 
 
758 aa  177  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  24.68 
 
 
758 aa  177  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  24.68 
 
 
764 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  24.77 
 
 
758 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  24.8 
 
 
760 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  25.14 
 
 
760 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2777  nitrate reductase  24.4 
 
 
731 aa  174  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  24.75 
 
 
858 aa  173  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  25.42 
 
 
695 aa  172  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0610  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.84 
 
 
804 aa  169  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.124465  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1668  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.08 
 
 
811 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01557  oxidoreductase subunit  26.22 
 
 
807 aa  169  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.405121  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2055  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.22 
 
 
798 aa  169  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  24.74 
 
 
722 aa  169  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1795  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  26.22 
 
 
807 aa  169  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725278  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01547  hypothetical protein  26.22 
 
 
807 aa  169  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.475009  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2042  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  26.22 
 
 
807 aa  169  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1674  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.05 
 
 
811 aa  168  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.666152  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2297  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  26.1 
 
 
798 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000563804 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  22.98 
 
 
759 aa  167  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1661  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  26.19 
 
 
807 aa  167  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1600  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.97 
 
 
811 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573894  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1609  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.83 
 
 
811 aa  167  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  25.71 
 
 
760 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  28.15 
 
 
761 aa  166  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1841  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.72 
 
 
811 aa  165  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  24.49 
 
 
757 aa  163  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  23.85 
 
 
760 aa  162  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  25.88 
 
 
764 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  22.81 
 
 
739 aa  162  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  25.35 
 
 
764 aa  162  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.21 
 
 
953 aa  162  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  24.96 
 
 
764 aa  161  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1418  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  24.36 
 
 
814 aa  161  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  29.86 
 
 
732 aa  161  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2256  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  25.98 
 
 
816 aa  161  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  25.26 
 
 
764 aa  160  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  22.11 
 
 
934 aa  160  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  25.49 
 
 
760 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1774  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  25.95 
 
 
752 aa  159  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.46 
 
 
814 aa  158  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3677  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  25.24 
 
 
838 aa  157  8e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00898  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A  24.46 
 
 
814 aa  157  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0778088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2749  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.46 
 
 
814 aa  157  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0999  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.46 
 
 
814 aa  157  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0266  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  25.24 
 
 
838 aa  157  9e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2702  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  24.46 
 
 
814 aa  157  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.98868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2226  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.6 
 
 
814 aa  157  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00905  hypothetical protein  24.46 
 
 
814 aa  157  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0839348  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1078  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.86 
 
 
814 aa  157  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.965114 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  23.63 
 
 
978 aa  157  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.46 
 
 
814 aa  157  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1208  molybdopterin oxidoreductase  26.83 
 
 
947 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  27.93 
 
 
731 aa  155  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1063  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.74 
 
 
814 aa  155  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0105709  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.74 
 
 
814 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0422  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  23.43 
 
 
806 aa  154  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0580651  decreased coverage  0.000000000595111 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  23.87 
 
 
756 aa  154  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.27 
 
 
978 aa  153  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  23.46 
 
 
741 aa  152  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1687  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  24.88 
 
 
817 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914371  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.27 
 
 
973 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.27 
 
 
973 aa  153  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  23.27 
 
 
973 aa  153  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0998  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.23 
 
 
814 aa  152  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.181006  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1612  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  25.26 
 
 
820 aa  152  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1029  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.23 
 
 
814 aa  152  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  23.17 
 
 
973 aa  151  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.17 
 
 
978 aa  151  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  24.85 
 
 
747 aa  150  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1773  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  25.41 
 
 
808 aa  150  9e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1660  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  25.78 
 
 
808 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1613  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  25.75 
 
 
808 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  25.1 
 
 
936 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  22.32 
 
 
754 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  23.06 
 
 
973 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  23.71 
 
 
942 aa  148  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3684  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family protein  24.86 
 
 
838 aa  148  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  25.35 
 
 
808 aa  148  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  23.1 
 
 
698 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0345  nitrate reductase  24.11 
 
 
731 aa  148  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01556  oxidoreductase subunit  25.7 
 
 
808 aa  147  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.56782  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01546  hypothetical protein  25.7 
 
 
808 aa  147  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  22.1 
 
 
700 aa  147  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2043  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  25.23 
 
 
808 aa  147  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>