More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1118 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1118  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
452 aa  928    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000972917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3242  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  52.05 
 
 
441 aa  458  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1018  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  52.33 
 
 
441 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00729938  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.97 
 
 
660 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.291882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
452 aa  297  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
452 aa  290  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.57 
 
 
701 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000562313  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2534  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 
458 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.17 
 
 
666 aa  236  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.65 
 
 
1341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 
933 aa  232  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0365  ATP-binding region ATPase domain protein  42.8 
 
 
553 aa  229  5e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000920812  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.19 
 
 
773 aa  229  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 
408 aa  229  8e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000201785  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 
514 aa  227  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 
441 aa  224  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0107  ATP-binding region ATPase domain protein  44.49 
 
 
540 aa  224  4e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2956  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.03 
 
 
780 aa  223  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.900663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 
780 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 
751 aa  219  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4132  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
619 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 
839 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2100  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 
751 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262959 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0376  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 
412 aa  217  4e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 
441 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1921  PAS sensor protein  40.46 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4041  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 
619 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0535  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 
554 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.92 
 
 
1171 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0595  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 
473 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 
712 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0465  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.58 
 
 
469 aa  212  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 
1255 aa  212  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0900  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 
409 aa  211  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
360 aa  210  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2778  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
756 aa  210  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 
1171 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
635 aa  209  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4136  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
440 aa  207  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000660181  hitchhiker  0.00876613 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 
930 aa  207  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346474  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
440 aa  206  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0687  ATP-binding region ATPase domain protein  40.81 
 
 
813 aa  203  6e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1396  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 
741 aa  201  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540787  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0894  ATP-binding region ATPase domain protein  41.2 
 
 
411 aa  199  6e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  39.78 
 
 
1306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1233  PAS sensor protein  38.96 
 
 
394 aa  194  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0449  ATP-binding region ATPase domain protein  35.4 
 
 
532 aa  194  4e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000148075  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
403 aa  193  6e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0891  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 
371 aa  189  9e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
404 aa  187  4e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1876  ATP-binding region ATPase domain protein  36.72 
 
 
572 aa  186  8e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1546  hypothetical protein  39.34 
 
 
552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0290  two component sensor histidine kinase  40.34 
 
 
689 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0779  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 
434 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 
475 aa  178  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2080  ATP-binding region ATPase domain protein  36.1 
 
 
542 aa  178  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0826  histidine kinase  36.84 
 
 
529 aa  176  6e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1040  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  36.17 
 
 
696 aa  173  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
592 aa  173  5.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.97 
 
 
566 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
503 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 
675 aa  170  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  56.94 
 
 
437 aa  169  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
556 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
397 aa  166  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2138  PAS sensor protein  33.86 
 
 
516 aa  164  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0721  hypothetical protein  38.43 
 
 
246 aa  164  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0783179  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2507  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  54.37 
 
 
488 aa  163  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0985  histidine kinase  33.73 
 
 
394 aa  159  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  49.03 
 
 
337 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  35.06 
 
 
856 aa  158  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2005  ATP-binding region ATPase domain protein  35.77 
 
 
617 aa  156  6e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.144674  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3976  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
431 aa  156  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0119459  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0463  histidine kinase  35.58 
 
 
465 aa  154  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000902576  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5143  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0979  histidine kinase  34.01 
 
 
687 aa  153  5e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
541 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 
386 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 
541 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0986  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.71 
 
 
487 aa  150  6e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1665  sensory box sensor histidine kinase, putative  31.34 
 
 
403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1720  two component LuxR family transcriptional regulator  44.77 
 
 
301 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1484  sensory box sensor histidine kinase, putative  31.34 
 
 
403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 
418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0735  ATP-binding region ATPase domain protein  33.19 
 
 
682 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0744  ATP-binding region ATPase domain protein  34.02 
 
 
616 aa  146  8.000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  58.27 
 
 
367 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  25.46 
 
 
443 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1179  ATP-binding region ATPase domain protein  33.73 
 
 
740 aa  145  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 
553 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 
386 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4238  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.74 
 
 
356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0704  ATP-binding region ATPase domain protein  32.92 
 
 
471 aa  141  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  55.38 
 
 
407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0979  response regulator receiver protein  50 
 
 
336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3147  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.62 
 
 
302 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.23 
 
 
1691 aa  140  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1761  two component LuxR family transcriptional regulator  49.63 
 
 
311 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  51.94 
 
 
304 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>