65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1028 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1028  protein of unknown function DUF1385  100 
 
 
307 aa  620  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0122365  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4062  hypothetical protein  77.2 
 
 
304 aa  487  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.055967  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2648  hypothetical protein  76.05 
 
 
308 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267473  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3105  hypothetical protein  77.12 
 
 
317 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.837646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0379  hypothetical protein  75.82 
 
 
316 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0386934  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3710  protein of unknown function DUF1385  73.94 
 
 
301 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.010982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3805  protein of unknown function DUF1385  73.62 
 
 
301 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3171  hypothetical protein  48.11 
 
 
292 aa  279  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104727  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4473  hypothetical protein  46.71 
 
 
327 aa  268  7e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0063  protein of unknown function DUF1385  50.52 
 
 
291 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000382  hitchhiker  0.00259146 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2155  hypothetical protein  45 
 
 
308 aa  265  8.999999999999999e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000573761  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2398  hypothetical protein  44.78 
 
 
302 aa  259  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000248355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0092  hypothetical protein  43.79 
 
 
308 aa  257  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0158548  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2873  protein of unknown function DUF1385  46.82 
 
 
295 aa  253  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000122593  hitchhiker  0.0000000114155 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1110  hypothetical protein  47.25 
 
 
307 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000475051  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2456  protein of unknown function DUF1385  40.73 
 
 
301 aa  246  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1328  hypothetical protein  46.6 
 
 
307 aa  246  3e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.23173  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0804  protein of unknown function DUF1385  43.62 
 
 
294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000749305  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2398  hypothetical protein  48.81 
 
 
318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.625274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1732  hypothetical protein  49.65 
 
 
313 aa  243  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0850  protein of unknown function DUF1385  45.39 
 
 
292 aa  243  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.218612  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2139  hypothetical protein  48.3 
 
 
313 aa  243  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2427  hypothetical protein  45.75 
 
 
318 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000256327  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  44.63 
 
 
587 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17980  predicted metal-dependent enzyme  42.57 
 
 
293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000596549  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  43.62 
 
 
587 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1139  hypothetical protein  45.9 
 
 
306 aa  236  3e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00478195  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1653  hypothetical protein  45.08 
 
 
302 aa  235  6e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09240  predicted metal-dependent enzyme  36.64 
 
 
391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.196919  normal  0.0286438 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1042  hypothetical protein  45.42 
 
 
285 aa  229  5e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.014485  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1069  protein of unknown function DUF1385  41.03 
 
 
313 aa  228  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.232778  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1213  hypothetical protein  44.3 
 
 
296 aa  224  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.727147  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1242  hypothetical protein  44.3 
 
 
296 aa  224  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0062  protein of unknown function DUF1385  47.46 
 
 
295 aa  224  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3374  protein of unknown function DUF1385  40 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0363757  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0844  hypothetical protein  41.08 
 
 
307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0412  hypothetical protein  42.42 
 
 
532 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452863  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0984  hypothetical protein  41.75 
 
 
315 aa  218  7e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20010  predicted metal-dependent enzyme  40.45 
 
 
342 aa  216  5e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0082  protein of unknown function DUF1385  36.83 
 
 
352 aa  210  3e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.547452  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0035  hypothetical protein  40.2 
 
 
320 aa  206  5e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000618498  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0452  putative lipoprotein  40.65 
 
 
335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0441  hypothetical protein  39.66 
 
 
304 aa  199  6e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000672255  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2983  putative lipoprotein  40 
 
 
337 aa  195  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1443  protein of unknown function DUF1385  40.26 
 
 
359 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2797  protein of unknown function DUF1385  39.8 
 
 
311 aa  192  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17231  normal  0.519199 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2300  protein of unknown function DUF1385  39.6 
 
 
304 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4331  hypothetical protein  38.31 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0230  protein of unknown function DUF1385  38.69 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3954  hypothetical protein  37.97 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4221  hypothetical protein  38.64 
 
 
306 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4311  hypothetical protein  37.97 
 
 
306 aa  182  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4105  hypothetical protein  37.97 
 
 
306 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4425  hypothetical protein  37.97 
 
 
306 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0923  hypothetical protein  37.97 
 
 
306 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4274  hypothetical protein  37.63 
 
 
306 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1129  protein of unknown function DUF1385  43.05 
 
 
468 aa  180  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.946733  hitchhiker  0.000313529 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4054  hypothetical protein  37.97 
 
 
306 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2895  hypothetical protein  36.95 
 
 
308 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0132011  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0820  protein of unknown function DUF1385  41.61 
 
 
324 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00433715  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2343  protein of unknown function DUF1385  39.2 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3943  hypothetical protein  37.68 
 
 
288 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0037  metal-dependent enzyme-like protein  31.13 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3638  protein of unknown function DUF1385  29.85 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1262  hypothetical protein  29.6 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.986286  normal  0.904358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>