More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1014 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  100 
 
 		 588 aa  1195    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  54.67 
 
 		 584 aa  650    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  48.47 
 
 		 588 aa  571  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  46.89 
 
 		 582 aa  544  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  47.28 
 
 		 587 aa  542  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  46.98 
 
 		 583 aa  541  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  46.36 
 
 		 587 aa  544  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  40.97 
 
 		 604 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  40.33 
 
 		 614 aa  334  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  42.21 
 
 		 605 aa  333  7.000000000000001e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  36.1 
 
 		 601 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  39.62 
 
 		 613 aa  325  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  42.82 
 
 		 619 aa  324  3e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  41.27 
 
 		 605 aa  313  3.9999999999999997e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  37.02 
 
 		 598 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  37.58 
 
 		 604 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  36.38 
 
 		 600 aa  306  7e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  40.48 
 
 		 599 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  36.44 
 
 		 593 aa  303  4.0000000000000003e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  31.41 
 
 		 599 aa  301  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  39.23 
 
 		 648 aa  299  7e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  39.57 
 
 		 641 aa  297  3e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  36.36 
 
 		 634 aa  295  1e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  35.48 
 
 		 544 aa  296  1e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  34.5 
 
 		 673 aa  295  2e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 604 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  35.75 
 
 		 600 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  36 
 
 		 662 aa  295  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  34.99 
 
 		 660 aa  293  5e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  34.92 
 
 		 595 aa  293  7e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  36.64 
 
 		 571 aa  292  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  36.26 
 
 		 598 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  36.26 
 
 		 598 aa  292  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  36.26 
 
 		 598 aa  292  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  36.26 
 
 		 598 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  36.26 
 
 		 598 aa  292  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  36.43 
 
 		 598 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  34.57 
 
 		 629 aa  291  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  36.43 
 
 		 598 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  35.01 
 
 		 632 aa  291  2e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  38.72 
 
 		 599 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  35.02 
 
 		 633 aa  291  3e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  36.26 
 
 		 598 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  38.25 
 
 		 595 aa  289  8e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  38 
 
 		 595 aa  289  9e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  34.99 
 
 		 646 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  34.99 
 
 		 646 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  40.38 
 
 		 645 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  37.63 
 
 		 616 aa  289  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  36.19 
 
 		 660 aa  288  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  34.03 
 
 		 657 aa  288  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  35.87 
 
 		 624 aa  287  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  35.66 
 
 		 652 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  31.9 
 
 		 626 aa  287  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  36.07 
 
 		 636 aa  287  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  34.42 
 
 		 640 aa  286  5.999999999999999e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  36.96 
 
 		 632 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  33.89 
 
 		 623 aa  286  7e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  38.43 
 
 		 655 aa  286  7e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  37.28 
 
 		 667 aa  286  9e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  37.73 
 
 		 539 aa  286  9e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  33.56 
 
 		 611 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  35.73 
 
 		 598 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  36.36 
 
 		 605 aa  285  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  38.24 
 
 		 639 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  36.36 
 
 		 605 aa  285  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  37.38 
 
 		 674 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  35.32 
 
 		 617 aa  284  4.0000000000000003e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  32.58 
 
 		 623 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  39.72 
 
 		 657 aa  283  5.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  35.36 
 
 		 704 aa  283  5.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  33.96 
 
 		 653 aa  283  6.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  33.33 
 
 		 656 aa  282  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  36.84 
 
 		 618 aa  282  1e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  37.12 
 
 		 616 aa  281  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  36.79 
 
 		 601 aa  280  4e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  34.82 
 
 		 626 aa  280  7e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  33.46 
 
 		 640 aa  279  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  33.47 
 
 		 651 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  36.67 
 
 		 651 aa  278  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  37.18 
 
 		 636 aa  277  5e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  35.16 
 
 		 703 aa  276  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  37.05 
 
 		 639 aa  276  8e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  35.29 
 
 		 686 aa  275  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  37.5 
 
 		 629 aa  275  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  35.67 
 
 		 632 aa  274  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  41.69 
 
 		 682 aa  274  3e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  39.55 
 
 		 576 aa  274  3e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  33.69 
 
 		 564 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  33.62 
 
 		 590 aa  272  1e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  37.39 
 
 		 629 aa  272  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  38.85 
 
 		 639 aa  272  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  37.25 
 
 		 598 aa  272  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  35.21 
 
 		 614 aa  272  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  33.41 
 
 		 656 aa  271  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  35.93 
 
 		 663 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  37.99 
 
 		 594 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  33.26 
 
 		 590 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  37.53 
 
 		 627 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  35.73 
 
 		 656 aa  270  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>