More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1002 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 280 aa  574  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  59.85 
 
 		 266 aa  328  4e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  57.69 
 
 		 266 aa  315  4e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  58.4 
 
 		 266 aa  308  5e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  55.08 
 
 		 264 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  52.34 
 
 		 265 aa  275  5e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  35.38 
 
 		 283 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  39.77 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  33.46 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  38.31 
 
 		 265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  35.91 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  37.45 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  37.07 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  35.91 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  36.78 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  39.53 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  36.05 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  32.14 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  35.32 
 
 		 255 aa  142  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  36.14 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  35.83 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  32.57 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  34.71 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.98 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  33.88 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  33.61 
 
 		 262 aa  122  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  33.2 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  31.68 
 
 		 265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  32.51 
 
 		 237 aa  119  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  30.42 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  34.24 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  31.98 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  29.86 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  33.87 
 
 		 282 aa  115  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 		 276 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  33.61 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  32.68 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  30.32 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  33.06 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  29.88 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 274 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  32.38 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  31 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  32.38 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  32.38 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  32.38 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  30.45 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  32.13 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  31.41 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  33.06 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  32.23 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  33.06 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  33.06 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  33.06 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  34 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.75 
 
 		 289 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  32.1 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  31.78 
 
 		 260 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  31.78 
 
 		 260 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  29.52 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  31.85 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  27.86 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  29.66 
 
 		 263 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1910  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 276 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1426  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  28.63 
 
 		 262 aa  108  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  31.92 
 
 		 301 aa  108  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3108  alpha/beta hydrolase fold protein  37.7 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962894  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  32.56 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  30.97 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1855  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121487  decreased coverage  0.00000000112067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  34.02 
 
 		 231 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  31.43 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  32.53 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30.68 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  29.8 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>