More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0980 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
347 aa  693  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  6.6828e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  87.83 
 
 
348 aa  625  1e-178  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  2.8278e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  88.76 
 
 
347 aa  611  1e-174  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.81914e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  87.9 
 
 
347 aa  609  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  87.9 
 
 
347 aa  609  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  7.07423e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  88.47 
 
 
347 aa  610  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  88.47 
 
 
347 aa  607  1e-172  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.83454e-11  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  84.15 
 
 
347 aa  580  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.97933e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  74.56 
 
 
344 aa  511  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  70.43 
 
 
346 aa  489  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  70.26 
 
 
343 aa  488  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  69.12 
 
 
344 aa  481  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  68.82 
 
 
344 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  69.28 
 
 
346 aa  478  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  68.53 
 
 
344 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  68.53 
 
 
344 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  68.99 
 
 
346 aa  477  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  68.7 
 
 
346 aa  477  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  69.57 
 
 
346 aa  477  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  67.35 
 
 
344 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  67.35 
 
 
344 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  67.65 
 
 
344 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  68.01 
 
 
347 aa  470  1e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.22229e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  65.6 
 
 
346 aa  454  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.02365e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  65.6 
 
 
343 aa  447  1e-125  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2820  rod shape-determining protein MreB  68.99 
 
 
346 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  65.41 
 
 
354 aa  445  1e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  63.82 
 
 
343 aa  432  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  64.79 
 
 
343 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  62.2 
 
 
343 aa  430  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  4.55643e-09 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  62.32 
 
 
348 aa  429  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  5.73376e-09 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  64.41 
 
 
343 aa  430  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  62.87 
 
 
346 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  61.54 
 
 
340 aa  428  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  63.25 
 
 
339 aa  429  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  7.59245e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  62.94 
 
 
346 aa  427  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  64.91 
 
 
344 aa  425  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  61.19 
 
 
342 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  60.9 
 
 
342 aa  421  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  60.81 
 
 
346 aa  421  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  61.7 
 
 
342 aa  423  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  61.4 
 
 
347 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  62.72 
 
 
343 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  6.77131e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  62.54 
 
 
348 aa  423  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  62.54 
 
 
347 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  1.88341e-06 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0187  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  60.41 
 
 
344 aa  424  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00128251  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  60.18 
 
 
350 aa  419  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  61.29 
 
 
347 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.38277e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  60.83 
 
 
345 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  60.83 
 
 
345 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  61.58 
 
 
347 aa  420  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  61.29 
 
 
347 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1412  rod shape-determining protein MreB  62.65 
 
 
344 aa  421  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  4.97097e-08  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  61.29 
 
 
347 aa  419  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  61 
 
 
347 aa  416  1e-115  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  5.07844e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  61 
 
 
347 aa  416  1e-115  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  1.54905e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  61 
 
 
347 aa  416  1e-115  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  60.6 
 
 
338 aa  417  1e-115  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  61.29 
 
 
347 aa  417  1e-115  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  4.73686e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  61 
 
 
347 aa  416  1e-115  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  6.4313e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  61 
 
 
347 aa  416  1e-115  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  3.07307e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  60.36 
 
 
344 aa  416  1e-115  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  61 
 
 
347 aa  416  1e-115  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.18605e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  59.59 
 
 
349 aa  415  1e-115  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  3.06946e-05  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  61 
 
 
347 aa  416  1e-115  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  6.17813e-05  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  61 
 
 
347 aa  416  1e-115  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  2.38726e-07  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  59.76 
 
 
339 aa  415  1e-115  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  60.06 
 
 
339 aa  417  1e-115  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  61 
 
 
347 aa  416  1e-115  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  61 
 
 
347 aa  416  1e-115  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  60.06 
 
 
339 aa  417  1e-115  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  60.77 
 
 
348 aa  416  1e-115  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  61 
 
 
347 aa  416  1e-115  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  5.1141e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  59.76 
 
 
339 aa  415  1e-115  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  64.07 
 
 
336 aa  414  1e-115  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  61 
 
 
347 aa  416  1e-115  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  6.01391e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  61.11 
 
 
347 aa  417  1e-115  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  60.95 
 
 
340 aa  417  1e-115  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  60.06 
 
 
339 aa  416  1e-115  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  58.19 
 
 
343 aa  416  1e-115  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  59.88 
 
 
349 aa  417  1e-115  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  7.01456e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  61 
 
 
347 aa  416  1e-115  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  2.36359e-11  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  61 
 
 
347 aa  416  1e-115  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.27973e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  59.76 
 
 
339 aa  415  1e-115  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  59.76 
 
 
339 aa  415  1e-115  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  59.76 
 
 
339 aa  415  1e-115  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  59.76 
 
 
339 aa  415  1e-115  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  59.76 
 
 
339 aa  415  1e-115  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  61 
 
 
347 aa  416  1e-115  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  1.55968e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2491  rod shape-determining protein MreB  61.85 
 
 
347 aa  416  1e-115  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00448666  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0100  rod shape-determining protein MreB  59.94 
 
 
347 aa  415  1e-115  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  59.59 
 
 
349 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.43177e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  57.6 
 
 
343 aa  413  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  59.76 
 
 
339 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  60.6 
 
 
347 aa  412  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00264  rod shape-determining protein MreB  60.95 
 
 
347 aa  412  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  1.19217e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  60.6 
 
 
347 aa  412  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  59.88 
 
 
348 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1465  rod shape-determining protein MreB  58.53 
 
 
345 aa  411  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28948  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  60.06 
 
 
347 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>