19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0939 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0939  FG-GAP repeat protein  100 
 
 
568 aa  1145    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.659758  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3121  hypothetical protein  42.72 
 
 
574 aa  168  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.78567e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3256  hypothetical protein  33.64 
 
 
510 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000373547  hitchhiker  9.15864e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3306  hypothetical protein  30 
 
 
505 aa  134  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00244316  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3253  hypothetical protein  31.88 
 
 
510 aa  126  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000436664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0660  hypothetical protein  28.36 
 
 
492 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00298688  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0012  integrin-like repeat-containing protein  27.27 
 
 
565 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0520  hypothetical protein  29.34 
 
 
505 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000613286  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0554  hypothetical protein  27.31 
 
 
476 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000494552  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2185  hypothetical protein  30.13 
 
 
498 aa  103  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000017001  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1310  hypothetical protein  28.76 
 
 
376 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0567  hypothetical protein  23.39 
 
 
476 aa  101  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.15788e-22 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0197  hypothetical protein  26.78 
 
 
555 aa  96.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2025  hypothetical protein  26.39 
 
 
554 aa  94.4  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2324  FG-GAP repeat protein  23.67 
 
 
561 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000100122  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0121  hypothetical protein  22.46 
 
 
558 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1746  hypothetical protein  24.06 
 
 
614 aa  70.5  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000631337  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0311  hypothetical protein  20.71 
 
 
535 aa  65.5  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000410606  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1882  hypothetical protein  23.78 
 
 
552 aa  57.4  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785906 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>