15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0838 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0838    100 
 
 		 3315 bp  6571    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00135022  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  83.78 
 
 		 1998 bp  206  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  81.89 
 
 		 2094 bp  139  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2881    85.71 
 
 		 585 bp  119  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  81.9 
 
 		 2001 bp  115  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  80.25 
 
 		 2019 bp  101  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  92.31 
 
 		 2001 bp  89.7  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0955  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 2019 bp  69.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00880864  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  81.9 
 
 		 1977 bp  63.9  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1791  TrkA-N family protein  94.44 
 
 		 1719 bp  56  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0156  hypothetical protein  100 
 
 		 462 bp  56  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.233702  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3409    84.29 
 
 		 2156 bp  52  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  92.11 
 
 		 2001 bp  52  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  96.55 
 
 		 2025 bp  50.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  91.89 
 
 		 2226 bp  50.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>