247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0751 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
111 aa  220  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  61.62 
 
 
111 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  58.88 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  58.88 
 
 
112 aa  125  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  49.09 
 
 
110 aa  104  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  49.09 
 
 
111 aa  97.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  43.12 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  43.93 
 
 
121 aa  92  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  37.27 
 
 
110 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  46.07 
 
 
111 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  36.94 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2529  anti-sigma-factor antagonist  38.38 
 
 
100 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  34.55 
 
 
110 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  36.79 
 
 
110 aa  79  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  42.34 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  42.55 
 
 
249 aa  78.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  31.86 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  31.86 
 
 
116 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  38.18 
 
 
111 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  39.22 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  38.18 
 
 
116 aa  73.6  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  38.14 
 
 
250 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  31.63 
 
 
116 aa  70.1  0.00000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  33.02 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  32.04 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  30.84 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  34.21 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.56 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  30.97 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  34.23 
 
 
269 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  29.2 
 
 
116 aa  67  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  37.76 
 
 
250 aa  67  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  37.62 
 
 
115 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  39.08 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  32.08 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2409  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2062  anti-sigma F factor antagonist (stage II sporulation protein AA)  36 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.360402  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  34.31 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2083  anti-anti-sigma factor  32.65 
 
 
183 aa  63.5  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  30.63 
 
 
120 aa  63.5  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0998  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 
123 aa  63.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1506  anti-sigma-factor antagonist  36.73 
 
 
405 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  28.7 
 
 
117 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 
116 aa  61.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  27.72 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1451  hypothetical protein  42.39 
 
 
98 aa  60.8  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  24.07 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1796  hypothetical protein  26.85 
 
 
782 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  29.63 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2937  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 
101 aa  58.2  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.64 
 
 
134 aa  58.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0733  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  32 
 
 
101 aa  57  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515917  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 
117 aa  57  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0046  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  26.17 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 
105 aa  57  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  27.1 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  27.68 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  27.68 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  27.68 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  27.68 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  27.68 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  27.68 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  27.68 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  27.68 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0208  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 
103 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  27.68 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3493  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 
123 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.892416  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  26.17 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  25.77 
 
 
117 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  28.41 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  33.94 
 
 
119 aa  54.3  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  28.41 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 
123 aa  53.9  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  27 
 
 
115 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  29.46 
 
 
114 aa  53.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1161  anti-sigma-factor antagonist  28.18 
 
 
436 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.871215  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 
116 aa  52.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  27.72 
 
 
120 aa  52.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  26.36 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03912  anti-sigma F factor antagonist  35.06 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4094  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  27.27 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 
111 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  25.69 
 
 
114 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>