More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0695 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0695  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
499 aa  1025    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000410524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0393  lytic transglycosylase, catalytic  62.75 
 
 
498 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00582053  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1010  Slt family transglycosylase  54.23 
 
 
506 aa  533  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4010  lytic transglycosylase, catalytic  57.48 
 
 
507 aa  524  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000241761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2556  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  54.11 
 
 
499 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000626959  hitchhiker  0.0000000459399 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0489  Lytic transglycosylase catalytic  59.6 
 
 
487 aa  496  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000573639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0472  lytic transglycosylase catalytic protein  58.6 
 
 
484 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  39.88 
 
 
617 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  40.05 
 
 
638 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  36.91 
 
 
733 aa  263  8e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  40.25 
 
 
544 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3789  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  37.09 
 
 
572 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3846  Lytic transglycosylase catalytic  37.75 
 
 
573 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3932  Lytic transglycosylase catalytic  37.75 
 
 
573 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2744  Lytic transglycosylase catalytic  35.92 
 
 
448 aa  230  5e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.42143e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1895  Lytic transglycosylase catalytic  33.8 
 
 
693 aa  229  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  36.81 
 
 
620 aa  226  7e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  35.24 
 
 
544 aa  221  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  34.14 
 
 
587 aa  220  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  36.55 
 
 
547 aa  204  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  34.07 
 
 
548 aa  203  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  32.78 
 
 
618 aa  200  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.06 
 
 
554 aa  195  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  30.94 
 
 
553 aa  193  7e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  33.77 
 
 
556 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  35.11 
 
 
524 aa  192  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  32.97 
 
 
517 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.12 
 
 
543 aa  189  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  31.53 
 
 
447 aa  189  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1043  lytic transglycosylase, catalytic  39.61 
 
 
281 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0755702  hitchhiker  0.000682757 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1987  Dyp-type peroxidase  33.71 
 
 
403 aa  188  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  35.11 
 
 
539 aa  188  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1191  regulatory protein dnir  31.54 
 
 
404 aa  187  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  32.02 
 
 
518 aa  187  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 
580 aa  186  9e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  34.4 
 
 
515 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  31.82 
 
 
552 aa  183  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  34.13 
 
 
515 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  36.52 
 
 
498 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  33.24 
 
 
514 aa  182  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  34.68 
 
 
515 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  33.6 
 
 
515 aa  181  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0459  putative Signal recognition particle protein (Fifty-four-like protein)  31.62 
 
 
403 aa  179  1e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.53 
 
 
532 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  33.25 
 
 
595 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  33.79 
 
 
527 aa  177  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  34.5 
 
 
495 aa  176  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  30.81 
 
 
479 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  32 
 
 
495 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  33.15 
 
 
442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  31.15 
 
 
518 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  33.24 
 
 
519 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  30.27 
 
 
479 aa  173  5e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  31.97 
 
 
539 aa  173  5.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  31.87 
 
 
519 aa  172  9e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  31.87 
 
 
515 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  31.87 
 
 
515 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  31.87 
 
 
515 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  29.53 
 
 
517 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  30.2 
 
 
511 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  33.16 
 
 
476 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  33.92 
 
 
476 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  33.92 
 
 
476 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  30.12 
 
 
523 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0661  Lytic transglycosylase catalytic  30.08 
 
 
415 aa  169  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.398223  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  31.63 
 
 
555 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29630  Peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N domain protein  33.7 
 
 
446 aa  168  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925428  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  30.9 
 
 
523 aa  167  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  29.75 
 
 
498 aa  167  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  34.22 
 
 
473 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0908  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.15 
 
 
475 aa  166  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  30.05 
 
 
519 aa  163  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  33.24 
 
 
534 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  31.32 
 
 
499 aa  162  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  31.32 
 
 
487 aa  162  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1857  lytic transglycosylase, catalytic  31.19 
 
 
485 aa  161  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  30.84 
 
 
661 aa  161  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.6 
 
 
530 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.51 
 
 
464 aa  160  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.04 
 
 
457 aa  160  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2183  lytic transglycosylase, catalytic  31.62 
 
 
492 aa  160  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.96919  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1988  lytic transglycosylase, catalytic  31.48 
 
 
474 aa  160  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  33.33 
 
 
534 aa  159  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00204  predicted membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.32 
 
 
452 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.35 
 
 
515 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0216  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.32 
 
 
452 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.806422  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1742  lytic transglycosylase, catalytic  32.16 
 
 
504 aa  159  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785643  normal  0.0879149 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00209  hypothetical protein  32.32 
 
 
452 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.133083  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1976  Lytic transglycosylase catalytic  32.16 
 
 
504 aa  159  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  28.57 
 
 
596 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3454  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.32 
 
 
452 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0215  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.32 
 
 
452 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00533886  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0223  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.32 
 
 
406 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0225  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.32 
 
 
406 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459174  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0207  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.15 
 
 
452 aa  158  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  29.1 
 
 
546 aa  157  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.04 
 
 
457 aa  158  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1051  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.08 
 
 
459 aa  157  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1105  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.08 
 
 
472 aa  157  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1666  peptidoglycan-binding protein LysM  34.93 
 
 
501 aa  157  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>