More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0662 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 545 aa  1104    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3282  radical SAM domain-containing protein  55.79 
 
 		 563 aa  570  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0422762  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3961  radical SAM domain-containing protein  50.54 
 
 		 566 aa  549  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0418  radical SAM family protein  51.72 
 
 		 557 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3062  radical SAM domain-containing protein  51.44 
 
 		 563 aa  527  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.477497  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0548  Radical SAM domain protein  47.05 
 
 		 557 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.011862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0560  Radical SAM domain protein  47.02 
 
 		 557 aa  477  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.12594e-30 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2195  Fe-S oxidoreductase  44.06 
 
 		 573 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3475  radical SAM domain-containing protein  41.68 
 
 		 613 aa  398  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00430694  normal  0.324644 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3766  radical SAM domain-containing protein  42.4 
 
 		 593 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3781  Radical SAM domain protein  40.79 
 
 		 589 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3698  Radical SAM domain protein  40.79 
 
 		 589 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.360742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3640  radical SAM family protein  41.17 
 
 		 589 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0327  radical SAM domain-containing protein  36.4 
 
 		 544 aa  341  2e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00004315  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_288  radical SAM domain protein  37.41 
 
 		 559 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000164247  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0348  radical SAM domain-containing protein  37.78 
 
 		 544 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000123778  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1241  Radical SAM domain protein  32.45 
 
 		 551 aa  302  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0874851  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0512  Radical SAM domain protein  32.23 
 
 		 852 aa  265  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00242025  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3787  Radical SAM domain protein  36.3 
 
 		 525 aa  262  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182556  normal  0.243034 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2565  radical SAM domain-containing protein  29.59 
 
 		 628 aa  258  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14150  Radical SAM domain protein  30.27 
 
 		 626 aa  254  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000319843  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4341  Radical SAM domain protein  31.08 
 
 		 618 aa  254  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  31.39 
 
 		 599 aa  254  3e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  30.66 
 
 		 599 aa  252  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2131  Radical SAM domain protein  31.4 
 
 		 613 aa  251  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0387  Radical SAM domain protein  33.6 
 
 		 860 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0670  hypothetical protein  33.27 
 
 		 898 aa  250  4e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0267  Radical SAM domain protein  33.13 
 
 		 874 aa  250  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148371  decreased coverage  0.00763103 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  33.46 
 
 		 638 aa  250  5e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  31.76 
 
 		 828 aa  249  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1280  radical SAM family protein  33.62 
 
 		 879 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00695626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  32.41 
 
 		 828 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  30.85 
 
 		 597 aa  248  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1455  radical SAM domain-containing protein  32.21 
 
 		 619 aa  246  8e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1317  Radical SAM domain protein  30.02 
 
 		 614 aa  246  9e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0554  radical SAM family protein  32.71 
 
 		 626 aa  245  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0586  radical SAM family protein  33.2 
 
 		 544 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  31.76 
 
 		 828 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1159  radical SAM family protein  32.61 
 
 		 510 aa  244  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.044499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  30.76 
 
 		 826 aa  243  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2123  radical SAM domain-containing protein  30.6 
 
 		 617 aa  242  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  32.35 
 
 		 842 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1202  Radical SAM domain protein  32.16 
 
 		 600 aa  241  2e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0312  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.88 
 
 		 887 aa  241  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2030  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.98 
 
 		 894 aa  240  5.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  30.71 
 
 		 910 aa  239  8e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2669  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.26 
 
 		 528 aa  239  1e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0247408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3436  Radical SAM domain protein  32.22 
 
 		 537 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587564 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  31.05 
 
 		 842 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0662  Radical SAM domain protein  32.99 
 
 		 856 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0877  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.48 
 
 		 872 aa  238  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4039  Radical SAM domain protein  29.54 
 
 		 538 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461651 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0676  Radical SAM domain protein  30.76 
 
 		 621 aa  237  4e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00732227  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4678  radical SAM domain-containing protein  32.01 
 
 		 543 aa  237  4e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0682  Radical SAM domain protein  32.99 
 
 		 857 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.877734 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0525  Radical SAM domain protein  30.31 
 
 		 657 aa  237  5.0000000000000005e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268937  normal  0.0105227 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0156  radical SAM family protein  29.97 
 
 		 613 aa  236  6e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1644  radical SAM domain-containing protein  33.2 
 
 		 864 aa  236  9e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2601  Radical SAM domain protein  31.69 
 
 		 553 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2388  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 		 617 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.938561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2100  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 		 617 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3328  Radical SAM domain protein  30.62 
 
 		 633 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00435818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16231  Fe-S oxidoreductase  31.33 
 
 		 882 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0179  radical SAM domain-containing protein  29.76 
 
 		 591 aa  233  6e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.11642  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2538  radical SAM domain-containing protein  31.41 
 
 		 624 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569062  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1025  Radical SAM domain protein  29.78 
 
 		 922 aa  232  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3784  Protein of unknown function DUF2344  34.52 
 
 		 971 aa  231  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539179  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  31.02 
 
 		 540 aa  231  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06130  Fe-S oxidoreductase  32.56 
 
 		 626 aa  231  3e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000171239 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1946  Radical SAM domain protein  33.61 
 
 		 619 aa  231  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7274  Fe-S oxidoreductase  29.53 
 
 		 636 aa  229  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.867612  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3484  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 		 663 aa  229  9e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0239  Beta tubulin, autoregulation binding site  29.85 
 
 		 897 aa  229  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0547979 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4375  Radical SAM domain protein  30.58 
 
 		 537 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  33.26 
 
 		 897 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4437  Radical SAM domain protein  30.58 
 
 		 537 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.07608 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  32.16 
 
 		 627 aa  228  3e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0978  radical SAM domain-containing protein  30.72 
 
 		 600 aa  227  5.0000000000000005e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14180  Fe-S oxidoreductase  30.24 
 
 		 626 aa  226  6e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  30.52 
 
 		 817 aa  226  6e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3863  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 		 661 aa  226  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.721561  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  32.08 
 
 		 812 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1610  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 		 849 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0753  radical SAM domain-containing protein  29.73 
 
 		 654 aa  225  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2192  Protein of unknown function DUF2344  30.87 
 
 		 842 aa  224  3e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1585  Radical SAM domain protein  28.92 
 
 		 642 aa  224  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458582  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1176  Radical SAM domain protein  29.65 
 
 		 655 aa  223  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0731  Radical SAM domain protein  32.77 
 
 		 898 aa  223  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0695  radical SAM family protein  32.76 
 
 		 898 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.609463  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 611 aa  222  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1701  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.07 
 
 		 860 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  29.95 
 
 		 610 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0730  Radical SAM domain protein  32.69 
 
 		 898 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2185  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.08 
 
 		 644 aa  216  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.972123  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1652  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.19 
 
 		 546 aa  216  9e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.606653  normal  0.975032 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2463  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 640 aa  216  9e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.123021 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  31.72 
 
 		 836 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1216  radical SAM family protein  29.3 
 
 		 679 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.837024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2298  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.32 
 
 		 465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217918  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1544  Radical SAM domain protein  29.84 
 
 		 640 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>